5'-N-4-methoxytrityl-5'-amino-5'-deoxythymidine-3'- | 166108-51-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-N-4-methoxytrityl-5'-amino-5'-deoxythymidine-3'-
• CAS: 166108-51-6
• 化学式: C₃₉H₄₉N₄O₆P
• 分子量: 700.815
• InChiKey: WXVUHFHSCLKSGL-MBWFQWBJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.66
• 重原子数：
  50.0
• 可旋转键数：
  16.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  107.05
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(p,p'-dimethoxytrityl)thymidine 3'-(allyl N,N-diisopropylphosphoramidite) 、 5'-N-4-methoxytrityl-5'-amino-5'-deoxythymidine-3'- 生成 [(2R,3S,5R)-2-(aminomethyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl] [(2R,3S,5R)-3-[hydroxy-[[(2R,3S,5R)-3-[hydroxy-[[(2R,3S,5R)-3-[hydroxy-[[(2R,3S,5R)-3-[hydroxy-[[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy]phosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy]phosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy]phosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy]phosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate
  参考文献：
  名称：

  使用标准合成规程直接连接的肽-寡脱氧核苷酸杂化物的固相合成

  摘要：

  我们描述了使用肌氨酸修饰的可控孔玻璃（CPG）支持并使用亚磷酰胺化学的寡核苷酸合成和Fmoc策略进行肽组装的直接连接的肽-寡核苷酸杂种的固相合成的一般方法。使用这种方法，不需要特殊的接头，并且可以用寡核苷酸序列进一步延长所得的肽-寡核苷酸杂合体。

  DOI：

  10.1016/0040-4039(95)00155-6
• 作为产物：
  描述：

  N,N,N',N'-四(1-甲基乙基)-二氨基亚磷酸 2-丙烯-1-基酯 、 5-氨基-5-脱氧胸腺嘧啶脱氧核苷 在 二异丙基铵盐四氮唑 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.5h， 以62%的产率得到5'-N-4-methoxytrityl-5'-amino-5'-deoxythymidine-3'-
  参考文献：
  名称：

  使用标准合成规程直接连接的肽-寡脱氧核苷酸杂化物的固相合成

  摘要：

  我们描述了使用肌氨酸修饰的可控孔玻璃（CPG）支持并使用亚磷酰胺化学的寡核苷酸合成和Fmoc策略进行肽组装的直接连接的肽-寡核苷酸杂种的固相合成的一般方法。使用这种方法，不需要特殊的接头，并且可以用寡核苷酸序列进一步延长所得的肽-寡核苷酸杂合体。

  DOI：

  10.1016/0040-4039(95)00155-6