N-[1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]-3-octa-1,7-diynyl-4-oxo-5H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-6-yl]-2-methylpropanamide | 1152162-15-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N-[1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]-3-octa-1,7-diynyl-4-oxo-5H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-6-yl]-2-methylpropanamide
• CAS: 1152162-15-6
• 化学式: C₅₂H₆₂N₇O₈P
• 分子量: 944.08
• InChiKey: BYXLLODCLNHEBD-OZGXIYPMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.3
• 重原子数：
  68
• 可旋转键数：
  23
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  171
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  1-(2-deoxy-5-O-(4,4'-dimethoxytriphenylmethyl)-β-D-erythro-pentofuranosyl)-6-[(2-methylpropanoyl)amino]-1,5-dihydro-3-(octa-1,7-diynyl)-4H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-one 、 2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 以72%的产率得到N-[1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]-3-octa-1,7-diynyl-4-oxo-5H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-6-yl]-2-methylpropanamide
  参考文献：
  名称：

  8-Aza-7-脱氮鸟嘌呤核苷和具有辛二炔基侧链的寡核苷酸：合成，叠氮化物-炔烃“点击”反应的功能化和香豆素共轭物的核碱基特异性荧光猝灭†

  摘要：

  通过固相合成制备了 掺入8-氮杂-7-脱氮杂-2'-脱氧鸟苷（2d）的7-（八-1,7-二炔基）衍生物的寡核苷酸。通过Sonogashira交叉偶联反应引入2d的侧链，并合成亚磷酰胺（3a，3b）。与包含未官能化的8-氮杂7-脱氮基2'-脱氧鸟苷（2a）的双链体相比，含2d的双链体更加稳定，这表明这些侧链在双链体DNA中具有空间自由度。将核苷2d和含2d的寡核苷酸偶联到非荧光的3-azido-7-羟基香豆素上15，由Huisgen-Meldal-Sharpless做出的“点击”反应。吡唑并[3，4- d ]嘧啶核苷共轭物16显示出比相应的吡咯并[2，3- d ]嘧啶衍生物17更高的荧光强度。发现在染料缀合物17中的猝灭在单体缀合物阶段比在单链或双链DNA中更强。提出了核碱基-染料接触复合物，当核碱基是堆叠的一部分时，其在单体状态下比在DNA链中更有利。具有笨重的染料缀合物的侧链很好地容纳在

  DOI：

  10.1039/b822041g