N⁴-benzoyl-5'-O-(monomethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)cytidine 3'-N-morpholinomethylphosphoramidite | 101904-18-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N⁴-benzoyl-5'-O-(monomethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)cytidine 3'-N-morpholinomethylphosphoramidite
• 英文别名: N-[1-[(2R,3R,4R,5R)-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-[methoxy(morpholin-4-yl)phosphanyl]oxy-5-[[(4-methoxyphenyl)-diphenylmethoxy]methyl]oxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide
• CAS: 101904-18-1
• 化学式: C₄₇H₅₇N₄O₉PSi
• 分子量: 881.05
• InChiKey: ALKMCBFYHLEBQD-GNUWXFRUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.39
• 重原子数：
  62.0
• 可旋转键数：
  16.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  131.84
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(monomethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine 3'-N-morpholinomethylphosphoramidite 、 N⁴-benzoyl-5'-O-(monomethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)cytidine 3'-N-morpholinomethylphosphoramidite 生成
  参考文献：
  名称：

  Preparation of ribonucleoside 3′-O-phosphoramidites and their application to the automated solid phase synthesis of oligonucleotides

  摘要：

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)98753-7
• 作为产物：
  描述：

  morpholinomethylphosphonamidic chloride 、 2-氨基-2-苯基丙酸盐酸盐 以77%的产率得到N⁴-benzoyl-5'-O-(monomethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)cytidine 3'-N-morpholinomethylphosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  Preparation of ribonucleoside 3′-O-phosphoramidites and their application to the automated solid phase synthesis of oligonucleotides

  摘要：

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)98753-7

文献信息

• The automated chemical synthesis of long oligoribuncleotides using 2'-O-silylated ribonucleoside 3'-O-phosphoramidites on a controlled-pore glass support: synthesis of a 43-nucleotide sequence similar to the 3'-half molecule of an Escherichia coli formylmethionine tRNA
  作者：N. Usman、K. K. Ogilvie、M. Y. Jiang、R. J. Cedergren

  DOI：10.1021/ja00259a037

  日期：1987.12