2-(N-methylbenzamido)-5-[3-O-[2-cyanoethoxy(diisopropylamino)phosphino]-5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2-O,4-C-methylene-D-ribofuranosyl]thiazole | 1029931-28-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 2-(N-methylbenzamido)-5-[3-O-[2-cyanoethoxy(diisopropylamino)phosphino]-5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2-O,4-C-methylene-D-ribofuranosyl]thiazole
• CAS: 1029931-28-9
• 化学式: C₄₇H₅₃N₄O₈PS
• 分子量: 865.0
• InChiKey: ZZNHITXISGZEAW-HTFNMIBRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.32
• 重原子数：
  61.0
• 可旋转键数：
  19.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  124.84
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-(N-methylbenzamido)-5-[5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2-O,4-C-methylene-D-ribofuranosyl]thiazole 、 2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 以89%的产率得到2-(N-methylbenzamido)-5-[3-O-[2-cyanoethoxy(diisopropylamino)phosphino]-5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2-O,4-C-methylene-D-ribofuranosyl]thiazole
  参考文献：
  名称：

  Recognition of T·A interruption by 2′,4′-BNAs bearing heteroaromatic nucleobases through parallel motif triplex formation

  摘要：

  2'-O,4'-C-methylene bridged nucleic acid (2',4'-BNA) monomers bearing novel unnatural nucleobases, 4-(3-benzamidophenyl)-2-pyridone and 2-(N-methylbenzamido)thiazole, were synthesized and successfully incorporated into oligonucleotides. UV melting experiments showed that the corresponding oligonucleotide derivatives formed stable triplexes with dsDNA targets even in the presence of a T center dot A interruption. (C) 2007 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2007.12.043