4-O-benzyl-6-O-{4,6-O-benzylidene-3-O-[(R)-3-benzyloxy-hexadecanoyl]-2-deoxy-2-[(R)-3-octacosanoyloxy-hexadecan]amido-β-D-glucopyranosyl}-2-[(R)-3-benzyloxy-hexadecan]amido-3-O-[(R)-3-benzyloxy-hexadecanoyl]-2-deoxy-D-glucono-1,5-lactone | 548486-20-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 糖脂
• 英文名称: 4-O-benzyl-6-O-{4,6-O-benzylidene-3-O-[(R)-3-benzyloxy-hexadecanoyl]-2-deoxy-2-[(R)-3-octacosanoyloxy-hexadecan]amido-β-D-glucopyranosyl}-2-[(R)-3-benzyloxy-hexadecan]amido-3-O-[(R)-3-benzyloxy-hexadecanoyl]-2-deoxy-D-glucono-1,5-lactone
• 英文别名: 4-O-benzyl-6-O-{4,6-O-benzylidene-3-O-[(R)-3-benzyloxyhexadecanoyl]-2-deoxy-2-[(R)-3-octacosanoyloxyhexadecanoylamino]-β-D-glucopyranosyl}-2-[(R)-3-benzyloxyhexadecanoylamino]-3-O-[(R)-3-benzyloxyhexadecanoyl]-2-deoxy-D-glucono-1,5-lactone
• CAS: 548486-20-0
• 化学式: C₁₃₉H₂₂₄N₂O₁₈
• 分子量: 2211.31
• InChiKey: YDLKXLKJBIFIBS-HLTIDZEJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  36.34
• 重原子数：
  159.0
• 可旋转键数：
  103.0
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.74
• 拓扑面积：
  237.24
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  18.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-O-benzyl-6-O-{4,6-O-benzylidene-3-O-[(R)-3-benzyloxy-hexadecanoyl]-2-deoxy-2-[(R)-3-octacosanoyloxy-hexadecan]amido-β-D-glucopyranosyl}-2-[(R)-3-benzyloxy-hexadecan]amido-3-O-[(R)-3-benzyloxy-hexadecanoyl]-2-deoxy-D-glucono-1,5-lactone 在 palladium on activated charcoal 氢气 作用下， 以 四氢呋喃 、 叔丁醇 为溶剂， 20.0 ℃ 、103.42 kPa 条件下， 以80%的产率得到2-deoxy-6-O-{2-deoxy-3-O-[(R)-3-hydroxy-hexadecanoyl]-2-[(R)-3-octacosanoyloxy-hexadecan]amido-β-D-glucopyranosyl}-2-[(R)-3-hydroxy-hexadecan]amido-3-O-[(R)-3-hydroxy-hexadecanoyl]-D-glucono-1,5-lactone
  参考文献：
  名称：

  长链脂肪酸对根瘤菌sin-1脂质A拮抗活性的影响。

  摘要：

  来自固氮细菌根瘤菌 sin-1 的脂质 A 在结构上是不寻常的，因为缺乏磷酸盐并且存在 2-氨基葡萄糖酸内酯和极长链脂肪酸 27-羟基二十八烷酸 (27OHC28:0) 部分。这种结构上不寻常的脂质 A 可以拮抗大肠​​杆菌 LPS 诱导的人单核细胞产生 TNF-α。为了确定不寻常的长链 27-羟基二十二烷酸与拮抗特性的相关性，开发了一种高度收敛的策略来合成 R. sin-1 的脂质 A 的几种衍生物。化合物1是在C-2'处具有27-羟基二十二烷酸的天然R.sin-1脂质A，化合物2在该位置含有二十八烷酸部分，并且化合物3被短链十四烷酸修饰。对人类单核细胞系的细胞活化研究表明，二十八烷酸对于最佳拮抗特性非常重要。然而，天然 27-羟基二十八烷酸部分的羟基并不能解释抑制活性。由此产生的结构-活性关系对于设计治疗感染性休克的化合物非常重要。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2007.05.012
• 作为产物：
  描述：

  4-O-benzyl-6-O-{4,6-O-benzylidene-3-O-[(R)-3-benzyloxyhexadecanoyl]-2-deoxy-2-[(R)-3-octacosanoyloxyhexadecanoylamino]-β-D-glucopyranosyl}-2-[(R)-3-benzyloxyhexadecanoylamino]-3-O-[(R)-3-benzyloxyhexadecanoyl]-2-deoxy-D-glucopyranose 在 pyridinium chlorochromate 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以71%的产率得到4-O-benzyl-6-O-{4,6-O-benzylidene-3-O-[(R)-3-benzyloxy-hexadecanoyl]-2-deoxy-2-[(R)-3-octacosanoyloxy-hexadecan]amido-β-D-glucopyranosyl}-2-[(R)-3-benzyloxy-hexadecan]amido-3-O-[(R)-3-benzyloxy-hexadecanoyl]-2-deoxy-D-glucono-1,5-lactone
  参考文献：
  名称：

  长链脂肪酸对根瘤菌sin-1脂质A拮抗活性的影响。

  摘要：

  来自固氮细菌根瘤菌 sin-1 的脂质 A 在结构上是不寻常的，因为缺乏磷酸盐并且存在 2-氨基葡萄糖酸内酯和极长链脂肪酸 27-羟基二十八烷酸 (27OHC28:0) 部分。这种结构上不寻常的脂质 A 可以拮抗大肠​​杆菌 LPS 诱导的人单核细胞产生 TNF-α。为了确定不寻常的长链 27-羟基二十二烷酸与拮抗特性的相关性，开发了一种高度收敛的策略来合成 R. sin-1 的脂质 A 的几种衍生物。化合物1是在C-2'处具有27-羟基二十二烷酸的天然R.sin-1脂质A，化合物2在该位置含有二十八烷酸部分，并且化合物3被短链十四烷酸修饰。对人类单核细胞系的细胞活化研究表明，二十八烷酸对于最佳拮抗特性非常重要。然而，天然 27-羟基二十八烷酸部分的羟基并不能解释抑制活性。由此产生的结构-活性关系对于设计治疗感染性休克的化合物非常重要。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2007.05.012

文献信息

• Synthesis and Biological Evaluation of <i>Rhizobium </i><i>s</i><i>in</i>-1 Lipid A Derivatives
  作者：Alexei V. Demchenko、Margreet A. Wolfert、Balaji Santhanam、James N. Moore、Geert-Jan Boons

  DOI：10.1021/ja029316s

  日期：2003.5.1

  A highly convergent strategy for the synthesis of several derivatives of the lipid A of Rhizobium sin-1 has been developed. The approach employed the advanced intermediate 3-O-acetyl-6-O-(3-O-acetyl-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-2-phthalimido-beta-D-glucopyrano-syl)-2-azido-4-O-benzyl-2-deoxy-1 -thio-alpha-D-glucopyranoside (5), which is protected in such a way that the anomeric center, the C-2 and C-2' amino groups, and the C-3 and C-3' hydroxyls can be selectively functionalized. The synthetic strategy was used for the preparation of 2-deoxy-6-O-12-deoxy-3-O-[(R)-3-hydroxy-hexadecanoyl]-2-[(R)-3-octacosanoyloxy-hexadecan]amido-beta-D-glucopyranosyl}-2-[(R)-3-hydroxy-hexadecan]amido-3-O-[(R)-3-hydroxy-hexadecanoyl]- alpha-D-glucopyranose (11) and 2-deoxy-6-O-2-deoxy-3-O[(R)-3-hydroxy-hexadecanoyl]-2-[(R)-3-octacosanoyloxy-hexadecan]amido-D-glucopyranosyl}-2-[(R)-3-hydroxy-hexadecan]amido-3-O-[(R)-3-hydroxy-hexadecanoyl]-D-glucono-1,5-lactone (13), which contain an unusual octacosanoic acid moiety and differ in the oxidation state of the anomeric center. The results of biological studies indicate that 11 and 13 lack the proinflammatory effects of Escherichia coli lipopolysaccharicles (LPS). Furthermore, 13 emulated the ability of heterogeneous R. sin-1 LPS to antagonize enteric LPS, providing evidence for the critical role of the gluconolactone moiety of R. sin-1 LPS in mediating this antagonistic effect. Compound 13 is the first example of a lipid A derivative that is devoid of phosphate but possesses antagonistic properties, making it an attractive lead compound for development of a drug to use in the treatment of Gram-negative septicemia.