4-phenoxyacetylamino-1-[2-(2'deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-β-D-ribofuranosyl)ethyl]-2-(2-octylthioethyl)-6-oxopyrimidine | 1200444-03-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 4-phenoxyacetylamino-1-[2-(2'deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-β-D-ribofuranosyl)ethyl]-2-(2-octylthioethyl)-6-oxopyrimidine
• CAS: 1200444-03-6
• 化学式: C₅₀H₆₁N₃O₈S
• 分子量: 864.116
• InChiKey: YMFXCSHKCBFCJN-XYFKDZRBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.83
• 重原子数：
  62.0
• 可旋转键数：
  25.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  130.37
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-phenoxyacetylamino-1-[2-(2'deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-β-D-ribofuranosyl)ethyl]-2-(2-octylthioethyl)-6-oxopyrimidine 、 2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 以63%的产率得到4-phenoxyacetylamino-1-[2-(2'deoxy-3'-N,N-diisopropylcyanoethylphosphoramidyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-β-D-ribofuranosyl)ethyl]-2-(2-octylthioethyl)-6-oxopyrimidine
  参考文献：
  名称：

  Formation of highly selective and efficient interstrand cross-linking to thymine without photo-irradiation

  摘要：

  形成寡脱氧核苷酸（ODN）的链间交联（ICL）有望确保抑制基因表达。在这篇通讯中，我们报告了一种使用 4-氨基-2-乙烯基-6-氧代嘧啶衍生物对胸腺嘧啶进行高效和选择性 ICL 反应的方法。

  DOI：

  10.1039/b915381k
• 作为产物：
  描述：

  4-phenoxyacetylamino-1-[2-(2'deoxy-β-D-ribofuranosyl)ethyl]-2-(2-octylthioethyl)-6-oxopyrimidine 、 4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 在 吡啶 作用下， 以90%的产率得到4-phenoxyacetylamino-1-[2-(2'deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-β-D-ribofuranosyl)ethyl]-2-(2-octylthioethyl)-6-oxopyrimidine
  参考文献：
  名称：

  Formation of highly selective and efficient interstrand cross-linking to thymine without photo-irradiation

  摘要：

  形成寡脱氧核苷酸（ODN）的链间交联（ICL）有望确保抑制基因表达。在这篇通讯中，我们报告了一种使用 4-氨基-2-乙烯基-6-氧代嘧啶衍生物对胸腺嘧啶进行高效和选择性 ICL 反应的方法。

  DOI：

  10.1039/b915381k