N⁴-(3-(N-(Trifluoroacetyl)amino)propyl)-5'-dimethoxytrityl-2'-deoxycytidine | 109082-28-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N⁴-(3-(N-(Trifluoroacetyl)amino)propyl)-5'-dimethoxytrityl-2'-deoxycytidine
• 英文别名: N-[3-[[1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]amino]propyl]-2,2,2-trifluoroacetamide
• CAS: 109082-28-2
• 化学式: C₃₅H₃₇F₃N₄O₇
• 分子量: 682.697
• InChiKey: ZNMQLMCPSXBBPN-ILJQZKEFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.4
• 重原子数：
  49.0
• 可旋转键数：
  14.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.34
• 拓扑面积：
  133.17
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  氯(二异丙基氨基)甲氧基膦 、 N⁴-(3-(N-(Trifluoroacetyl)amino)propyl)-5'-dimethoxytrityl-2'-deoxycytidine 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 以82%的产率得到N⁴-(3-(N-(Trifluoroacetyl)amino)propyl)-5'-dimethoxytrityl-2'-deoxycytidine-3'-(O-methyl-N,N-diisopropyl)phosphoramidate
  参考文献：
  名称：

  含有共价连接分子标记的 DNA 寡聚体和双链体的合成和表征：通过热力学和光学光谱测量比较生物素、荧光素和芘标记

  摘要：

  Synthese de nucleotides modates, de la cytidine et de l'uridine, permettant la liaison avec des composesfluores tel que la biotine, le pyrenebutyrate-1, la fluorescesine, afin de rendrefluorescence des oligonucleotides

  DOI：

  10.1021/ja00200a011
• 作为产物：
  描述：

  N⁴-(3-Aminopropyl)-2'-deoxycytidine 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 26.0h， 生成 N⁴-(3-(N-(Trifluoroacetyl)amino)propyl)-5'-dimethoxytrityl-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  含有共价连接分子标记的 DNA 寡聚体和双链体的合成和表征：通过热力学和光学光谱测量比较生物素、荧光素和芘标记

  摘要：

  Synthese de nucleotides modates, de la cytidine et de l'uridine, permettant la liaison avec des composesfluores tel que la biotine, le pyrenebutyrate-1, la fluorescesine, afin de rendrefluorescence des oligonucleotides

  DOI：

  10.1021/ja00200a011

文献信息

• TELSER, JOSHUA;CRUICKSHANK, KENNETH A.;MORRISON, LARRY E.;NETZEL, THOMAS +, J. AMER. CHEM. SOC., 111,(1989) N8, C. 6966-6976
  作者：TELSER, JOSHUA、CRUICKSHANK, KENNETH A.、MORRISON, LARRY E.、NETZEL, THOMAS +

  DOI：——

  日期：——