腊伯罗霉素 | 28399-50-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 角环素
• 中文名称: 腊伯罗霉素
• 中文别名: 四癸二酸,3-羟基-
• 英文名称: Rebelomycin
• 英文别名: rabelomycin；(3R)-3,6,8-trihydroxy-3-methyl-2,4-dihydrobenzo[a]anthracene-1,7,12-trione
• CAS: 28399-50-0
• 化学式: C₁₉H₁₄O₆
• 分子量: 338.317
• InChiKey: JJOLHRYZQSDLSA-LJQANCHMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.21
• 拓扑面积：
  112
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

安全信息

• 海关编码：
  2914400090

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (R)-(S)-adenosyl-L-methionine 、 腊伯罗霉素 在 carminomycin 4-O-methyltransferase DnrK 、 N-His₆-S-adenosyl-L-homocysteinease 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 生成 (3~{R})-8-methoxy-3-methyl-3,6-bis(oxidanyl)-2,4-dihydrobenzo[a]anthracene-1,7,12-trione
  参考文献：
  名称：

  卡米霉素 4-O-甲基转移酶 DnrK 的生化和结构研究

  摘要：

  描述了卡米霉素 4-O-甲基转移酶 DnrK 的结构和功能研究，重点是询问 DnrK 的受体底物范围。具体来说，对 100 种结构和功能不同的天然产物和天然产物模拟物的评估揭示了一系列药效团作为生产性 DnrK 底物。本研究中新鉴定的代表性 DnrK 底物包括蒽环类、安环类、蒽醌融合的烯二炔、类黄酮、吡喃萘醌和聚酮类。与非天然荧光羟基香豆素受体 4-甲基伞形酮结合的 DnrK 的配体结合结构，以及 4-甲基伞形酮和天然受体卡米霉素的相应 DnrK 动力学参数也首次报道。DnrK 被证明的独特允许性突出了 DnrK 作为未来生物催化和/或应变工程应用的新工具的潜力。此外，一组精选 DnrK 底物/产品的比较生物活性评估（癌细胞系细胞毒性、4E-BP1 磷酸化和蝾螈胚胎尾部再生）突出了蒽环类药物 4-O-甲基化决定不同功能结果的能力。

  DOI：

  10.1021/acs.jnatprod.3c00947
• 作为产物：
  描述：

  angucyclinone UWM6 在 JadH 作用下， 生成 腊伯罗霉素
  参考文献：
  名称：

  JadH在Jadomycin生物合成中作为FAD和NAD（P）H依赖性双功能羟化酶/脱水酶的特征

  摘要：

  Angucyclines的生物合成：我们鉴定了辅助酶JadH作为FAD和依赖Jadomycin生物合成的NAD（P）H依赖性双功能羟化酶/脱水酶，方法是鉴定其真实产物。已在所有克隆的环霉素生物合成簇中发现了JadH的同系物，并被认为具有与JadH类似的功能。

  DOI：

  10.1002/cbic.201000178

文献信息

• Enzymatic Total Synthesis of Rabelomycin, an Angucycline Group Antibiotic
  作者：Madan Kumar Kharel、Pallab Pahari、Hui Lian、Jürgen Rohr

  DOI：10.1021/ol1009009

  日期：2010.6.18

  A one-pot enzymatic total synthesis of angucycline antibiotic rabelomycin was accomplished, starting from acetyl-CoA and malonyl-CoA, using a mixture of polyketide synthase (PKS) enzymes of the gilvocarcin, ravidomycin, and jadomycin biosynthetic pathways. The in vitro results were compared to in vivo catalysis using analogous sets of enzymes.

  从乙酰辅酶A和丙二酰辅酶A开始，使用gilvocarcin、拉维霉素和jadomycin生物合成途径的聚酮合酶(PKS)酶的混合物，完成了angucycline抗生素雷伯霉素的一锅酶促全合成。将体外结果与使用类似酶组的体内催化进行比较。
• Characterization of JadH as an FAD- and NAD(P)H-Dependent Bifunctional Hydroxylase/Dehydrase in Jadomycin Biosynthesis
  作者：Yihua Chen、Keqiang Fan、Yongzhi He、Xinping Xu、Yanfeng Peng、Tingting Yu、Cuijuan Jia、Keqian Yang

  DOI：10.1002/cbic.201000178

  日期：——

  Biosynthesis of angucyclines: We characterized an accessory enzyme, JadH as a FAD and NAD(P)H‐dependent bifunctional hydroxylase/dehydrase involved in jadomycin biosynthesis by identifying its real product. Homologues of JadH have been found in all cloned angucycline biosynthetic clusters and were proposed to have similar functions as JadH.

  Angucyclines的生物合成：我们鉴定了辅助酶JadH作为FAD和依赖Jadomycin生物合成的NAD（P）H依赖性双功能羟化酶/脱水酶，方法是鉴定其真实产物。已在所有克隆的环霉素生物合成簇中发现了JadH的同系物，并被认为具有与JadH类似的功能。
• Enzymatic Total Synthesis of Defucogilvocarcin M and Its Implications for Gilvocarcin Biosynthesis
  作者：Pallab Pahari、Madan K. Kharel、Micah D. Shepherd、Steven G. van Lanen、Jürgen Rohr

  DOI：10.1002/anie.201105882

  日期：2012.1.27

  Teamwork: Defucogilvocarcin M (1, see scheme) was synthesized in a one‐pot, enzymatic reaction from acetyl‐CoA and malonyl‐CoA by a combination of 15 enzymes obtained from E. coli as well as the gilvocarcin, jadomycin, and ravidomycin biosynthetic pathways. The mixture of enzymes was systematically reduced and varied to further delineate the sequence of reactions in the complex, post‐polyketide steps

  团队合作：Defucogilvocarcin M（1，见方案）是通过一锅法合成的，由乙酰辅酶A和丙二酰辅酶A通过15种酶的组合从乙酰辅酶A和丙二酰辅酶A中合成，并结合了从大肠杆菌中获得的15种酶以及gilvocarcin、jadomycin和ravidomycin生物合成途径。酶的混合物被系统地减少和改变，以进一步描绘 gilvocarcin 生物合成的复杂的聚酮化合物后步骤中的反应顺序。
• Biochemical and Structural Studies of the Carminomycin 4-<i>O</i>-Methyltransferase DnrK
  作者：Elnaz Jalali、Fengbin Wang、Brooke R. Overbay、Mitchell D. Miller、Khaled A. Shaaban、Larissa V. Ponomareva、Qing Ye、Hoda Saghaeiannejad-Esfahani、Minakshi Bhardwaj、Andrew D. Steele、Christiana N. Teijaro、Ben Shen、Steven G. Van Lanen、Qing-Bai She、S. Randal Voss、George N. Phillips、Jon S. Thorson

  DOI：10.1021/acs.jnatprod.3c00947

  日期：2024.4.26

  4-O-methyltransferase DnrK are described, with an emphasis on interrogating the acceptor substrate scope of DnrK. Specifically, the evaluation of 100 structurally and functionally diverse natural products and natural product mimetics revealed an array of pharmacophores as productive DnrK substrates. Representative newly identified DnrK substrates from this study included anthracyclines, angucyclines, anthraquinone-fused

  描述了卡米霉素 4-O-甲基转移酶 DnrK 的结构和功能研究，重点是询问 DnrK 的受体底物范围。具体来说，对 100 种结构和功能不同的天然产物和天然产物模拟物的评估揭示了一系列药效团作为生产性 DnrK 底物。本研究中新鉴定的代表性 DnrK 底物包括蒽环类、安环类、蒽醌融合的烯二炔、类黄酮、吡喃萘醌和聚酮类。与非天然荧光羟基香豆素受体 4-甲基伞形酮结合的 DnrK 的配体结合结构，以及 4-甲基伞形酮和天然受体卡米霉素的相应 DnrK 动力学参数也首次报道。DnrK 被证明的独特允许性突出了 DnrK 作为未来生物催化和/或应变工程应用的新工具的潜力。此外，一组精选 DnrK 底物/产品的比较生物活性评估（癌细胞系细胞毒性、4E-BP1 磷酸化和蝾螈胚胎尾部再生）突出了蒽环类药物 4-O-甲基化决定不同功能结果的能力。