3'-O-[(tert-butyl)dimethylsilyl]-5'-O-[13-(4-methoxyphenyl)-13,13-diphenyl-6,9-dioxa-3,12-diazatridec-1-yl]thymidine | 929075-72-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 3'-O-[(tert-butyl)dimethylsilyl]-5'-O-[13-(4-methoxyphenyl)-13,13-diphenyl-6,9-dioxa-3,12-diazatridec-1-yl]thymidine
• 英文别名: 1-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[2-[2-[2-[2-[[(4-methoxyphenyl)-diphenylmethyl]amino]ethoxy]ethoxy]ethylamino]ethoxymethyl]oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 929075-72-9
• 化学式: C₄₄H₆₂N₄O₈Si
• 分子量: 803.084
• InChiKey: BPJFXDOOKIYDIN-KQIHHXPCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.75
• 重原子数：
  57
• 可旋转键数：
  23
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  129
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-O-[(tert-butyl)dimethylsilyl]-5'-O-[13-(4-methoxyphenyl)-13,13-diphenyl-6,9-dioxa-3,12-diazatridec-1-yl]thymidine 在 三氯乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.17h， 以88%的产率得到5'-O-[2-{{2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethyl}amino}ethyl]-3'-O-[(tert-butyl)dimethylsilyl]thymidine
  参考文献：
  名称：

  带有长链接头的寡脱氧核苷酸的合成和杂交特性

  摘要：

  在其主链的长链连接基（6,9-二氧杂-3,12- diazatetradecane -1,14-二基）新合成寡核苷酸，并可以通过测量进行了研究其杂交性质Ť米曲线和荧光光谱。所述Ť米分析表明，这些寡核苷酸可以结合它们的互补链，尽管长链连接基的存在。我们还证明了在长链接头中两个N原子之一上具有蒽9-基甲基的寡聚脱氧核苷酸的有趣荧光性质。这些寡核苷酸与互补链杂交后，其荧光强度增加，并且对特定位置错配碱基对的存在敏感。

  DOI：

  10.1002/hlca.200790203
• 作为产物：
  描述：

  3'-O-[(tert-butyl)dimethylsilyl]-5'-O-(2-oxoethyl)thymidine 、 8-[N-di-phenyl-(4-methoxyphenyl)-methyl]-amino-3,6-dioxa-octylamine 在 三乙酰氧基硼氢化钠 作用下， 以 氯仿 为溶剂， 反应 0.67h， 以84%的产率得到3'-O-[(tert-butyl)dimethylsilyl]-5'-O-[13-(4-methoxyphenyl)-13,13-diphenyl-6,9-dioxa-3,12-diazatridec-1-yl]thymidine
  参考文献：
  名称：

  带有长链接头的寡脱氧核苷酸的合成和杂交特性

  摘要：

  在其主链的长链连接基（6,9-二氧杂-3,12- diazatetradecane -1,14-二基）新合成寡核苷酸，并可以通过测量进行了研究其杂交性质Ť米曲线和荧光光谱。所述Ť米分析表明，这些寡核苷酸可以结合它们的互补链，尽管长链连接基的存在。我们还证明了在长链接头中两个N原子之一上具有蒽9-基甲基的寡聚脱氧核苷酸的有趣荧光性质。这些寡核苷酸与互补链杂交后，其荧光强度增加，并且对特定位置错配碱基对的存在敏感。

  DOI：

  10.1002/hlca.200790203