2'-trifluoroacetamido-3'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyuridine | 219833-76-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 2'-trifluoroacetamido-3'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyuridine
• 英文别名: N-[(2R,3R,4S,5R)-4-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]-2-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-5-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]-2,2,2-trifluoroacetamide
• CAS: 219833-76-8
• 化学式: C₃₂H₃₀F₃N₃O₈
• 分子量: 641.601
• InChiKey: DRCYJRJWXOJETJ-YULOIDQLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.4
• 重原子数：
  46
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.28
• 拓扑面积：
  136
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  丁二酸酐 、 2'-trifluoroacetamido-3'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyuridine 在 4-二甲氨基吡啶 作用下， 以 吡啶 、 正己烷 、 二氯甲烷 、 甲苯 为溶剂， 生成 2'-trifluoroacetamido-3'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyuridine-5'-succinate
  参考文献：
  名称：

  Universal solid supports and methods for their use

  摘要：

  揭示了用于合成寡核苷酸的通用固体支持寡核苷酸合成试剂、寡核苷酸合成过程以及用于从固体支持中裂解寡核苷酸的试剂。寡核苷酸合成试剂具有以下一般公式：SS--R.sup.6 --O--R.sup.3，其中SS是固体支持；R.sup.6是##STR1##其中R.sup.5是氢或烷基，R.sup.4是磷酸酯保护基团；而R.sup.3是一个环基团，具有邻位基团--XR.sup.1和--YR.sup.2，其中X和Y分别独立地选自O、S和NH的群，R.sup.1和R.sup.2中的一个是阻断基团，另一个是氢或羟基保护基团。寡核苷酸裂解试剂包括甲胺和/或氢氧化铵以及三甲胺。

  公开号：

  US05869696A1

文献信息

• UNIVERSAL SOLID SUPPORTS AND METHODS FOR THEIR USE
  申请人：Beckman Coulter, Inc.

  公开号：EP0843684B1

  公开（公告）日：2003-08-20
• US5869696A
  申请人：——

  公开号：US5869696A

  公开（公告）日：1999-02-09
• Universal solid supports and methods for their use
  申请人：Beckman Instruments, Inc.

  公开号：US05869696A1

  公开（公告）日：1999-02-09

  Universal solid support oligonucleotide synthesis reagents, oligonucleotide synthesis processes, and reagents for cleaving oligonucleotides from solid supports are disclosed. Oligonucleotide synthesis reagents have the following general formula: SS--R.sup.6 --O--R.sup.3 I wherein SS is a solid support; R.sup.6 is ##STR1## where R.sup.5 is hydrogen or alkyl and R.sup.4 is a phosphate protecting group; and R.sup.3 is a ring moiety having vicinal groups --XR.sup.1 and --YR.sup.2 wherein each of X and Y is independently selected from the group consisting of O, S and NH and one of R.sup.1 and R.sup.2 is a blocking moiety and the other is hydrogen or a hydroxy protecting group. Oligonucleotide cleaving reagents include methylamine and/or ammonium hydroxide and trimethylamine.

  揭示了用于合成寡核苷酸的通用固体支持寡核苷酸合成试剂、寡核苷酸合成过程以及用于从固体支持中裂解寡核苷酸的试剂。寡核苷酸合成试剂具有以下一般公式：SS--R.sup.6 --O--R.sup.3，其中SS是固体支持；R.sup.6是##STR1##其中R.sup.5是氢或烷基，R.sup.4是磷酸酯保护基团；而R.sup.3是一个环基团，具有邻位基团--XR.sup.1和--YR.sup.2，其中X和Y分别独立地选自O、S和NH的群，R.sup.1和R.sup.2中的一个是阻断基团，另一个是氢或羟基保护基团。寡核苷酸裂解试剂包括甲胺和/或氢氧化铵以及三甲胺。