5,6-Difluoro-1-β-D-ribofuronasylbenzimidazole | 78582-01-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 苯并咪唑核糖核苷和核糖核苷酸
• 英文名称: 5,6-Difluoro-1-β-D-ribofuronasylbenzimidazole
• 英文别名: Difluororibofuranosylbenzimidazole；(2R,3R,4S,5R)-2-(5,6-difluorobenzimidazol-1-yl)-5-(hydroxymethyl)oxolane-3,4-diol
• CAS: 78582-01-1
• 化学式: C₁₂H₁₂F₂N₂O₄
• 分子量: 286.235
• InChiKey: KGTUTCCDAKKABM-DDHJBXDOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  87.7
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5,6-Difluoro-1-β-D-ribofuronasylbenzimidazole 以5%的产率得到5,6-Difluoro-1-β-D-ribofuranosylbenzimidazole 3',5'-phosphate
  参考文献：
  名称：

  1-β-d-呋喃核糖基苯并咪唑3'，5'-磷酸酯的衍生物模拟腺苷3'，5'-磷酸酯（cAMP）和鸟苷3'，5'-磷酸酯（cGMP）的作用

  摘要：

  根据MNDO方法预测的性质，设计了一系列1-β-D-呋喃呋喃糖基苯并咪唑3'，5'-磷酸酯（cBIMP）的新类似物，并由取代的苯并咪唑合成。通过MNDO方法计算每个苯并咪唑碱基的偶极子向量以及HOMO和LUMO能量，并确定cBIMP衍生物的亲脂性。通常，cBIMP衍生物激活cAMP依赖性蛋白激酶I和II，并优先结合位点B，特别是对于II型激酶，其中2-三氟甲基-cBIMP和5,6-二氟-cBIMP表现出最高的位点选择性。每个cBIMP衍生物都可以刺激cGMP刺激的环磷酸二酯酶（cGS-PDE），其中5,6-二甲基-cBIMP与cGMP一样有效，并且还可以抑制cGMP抑制的磷酸二酯酶（cGI-PDE）。仅2-三氟甲基-cBIMP和Rp-硫代磷酸酯（cBIMPS）（赤道P = S）对cPDE的水解具有抗性。如果有的话，将Sp-硫代磷酸酯缓慢水解。除了表现出高亲脂性外，用于诱导细胞凋亡和抑制增殖

  DOI：

  10.1016/0008-6215(92)85050-a
• 作为产物：
  描述：

  (9ci)-5,6-二氟-1H-苯并咪唑 在 甲醇 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 氨 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 49.0h， 生成 5,6-Difluoro-1-β-D-ribofuronasylbenzimidazole
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and biological evaluation of benzo[d]imidazole derivatives as potential anti-cancer agents

  摘要：

  We herein report the synthesis, biological activity and structure-activity relationship of derivatives of 5,6-dichloro-1-beta-D-ribofuranosylbenzimidazole and benzo[d]imidazole. A lead compound 6o demonstrates potent anti-proliferative activity and the ability to induce cancer cell apoptosis. (C) 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2011.12.088

文献信息

• Chemo-Enzymatic Synthesis and Biological Evaluation of 5,6-Disubstituted Benzimidazole Ribo- and 2′-Deoxyribonucleosides
  作者：Jan Balzarini、Igor Mikhailopulo、Irina Konstantinova、Olga Selezneva、Ilja Fateev、Tamara Balashova、Svetlana Kotovskaya、Zoya Baskakova、Valery Charushin、Alexander Baranovsky、Anatoly Miroshnikov

  DOI：10.1055/s-0032-1317782

  日期：——

  Abstract A number of new 5,6-disubstituted benzimidazoles have been prepared and their substrate properties for recombinant E. coli purine nucleoside phosphorylase (PNP; the product of the deoD gene) in the transglycosylation reaction were investigated. The heterocyclic­ bases showed good substrate activity for PNP and the ribo- and 2′-deoxyribonucleosides were synthesized. The predominant (OMe and

  摘要 已经制备了许多新的5，6-二取代的苯并咪唑，并研究了它们在转糖基化反应中对重组大肠杆菌嘌呤核苷磷酸化酶（PNP；deoD基因的产物）的底物性质。杂环碱基对PNP具有良好的底物活性，并合成了核糖和2'-脱氧核糖核苷。观察到5-取代的6-氟-1-（-1- d-核呋喃呋喃糖基）苯并咪唑的主要（OMe和OEt）或排他的（O i -Pr，吗啉代和N-甲基哌嗪子）形成。区域异构体6-甲氧基，6-乙氧基或6-异丙氧基取代的1-（2-脱氧-β- d的形成在相应碱基的反式-2-脱氧核糖基化反应中观察到-（呋喃核糖基）-5-氟苯并咪唑。具有6-氟苯并咪唑的大体积5-取代基的区域异构N 1-核苷的主要或排他性指向可容纳这些基团的大肠杆菌PNP活性位点中的大疏水口袋。对合成核苷的生物学活性进行了研究，发现对多种DNA和RNA病毒没有抑制活性。该化合物也缺乏明显的细胞毒性。 已经制备了许多新的5，6-二取代的
• Benzimidazoles in the Reaction of Enzymatic Transglycosylation
  作者：Igor Mikhailopulo、Zygmunt Kazimierczuk、Anatoli Zinchenko、Vladimir Barai、Valeria Romanova、Ludmilla Eroshevskaya

  DOI：10.1080/15257779508012409

  日期：1995.5.1

  Substrate activity of a broad spectrum of derivatives of benzimidazole in the reaction of enzymatic ribo- and 2-deoxyribosylation catalyzed by purine nucleoside phosphorylase of whole cells of E. coli BMT-1D/1A has been studied. Guanosine or 2'-deoxyguanosine were used as glycosyl donors.