Dihydrokalafungin | 52934-83-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 异色满醌
• 英文名称: Dihydrokalafungin
• 英文别名: Nanaomycin A；2-[(1R,3S)-9-hydroxy-1-methyl-5,10-dioxo-3,4-dihydro-1H-benzo[g]isochromen-3-yl]acetic acid
• CAS: 52934-83-5；73804-47-4；90761-55-0；142292-63-5；98392-26-8
• 化学式: C₁₆H₁₄O₆
• 分子量: 302.284
• InChiKey: ZCJHPTKRISJQTN-SFYZADRCSA-N

物化性质

• 熔点：
  179°C
• 沸点：
  363.32°C (rough estimate)
• 密度：
  1.2514 (rough estimate)
• 溶解度：
  不溶于水； DMSO 中≥15.1 mg/mL； ≥31.07 mg/mL，乙醇溶液，超声波

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.3
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  101
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

安全信息

• 危险类别码：
  R22,R24
• 危险品运输编号：
  UN 2811 6.1/PG 3

制备方法与用途

生物活性

Nanaomycin A 是第一个选择性 DNMT3B 抑制剂，IC50 为 500 nM。它是一种醌类抗生素，可重新激活人类癌细胞中沉默的抑癌基因。此外，Nanaomycin A 还能抑制体外恶性疟原虫的生长，IC80 值为 33.1 nM。

靶点

• DNMT3B：IC50 为 500 nM

体外研究

Nanaomycin A 在不同浓度 (10-10000 nM) 和时间 (72 小时) 下对三种细胞系均显示出显著的细胞毒性效应。

• Nanaomycin A（0.5, 5 μM；72 小时）诱导 A549 细胞中 RASSF1A 蛋白表达，具有 18 倍的相对诱导量。
• Nanaomycin A 不影响 DNMT1 的酶活性。

细胞毒性实验

• 细胞系：结肠癌 HCT116、肺癌 A549 和骨髓 HL60 人肿瘤细胞系
• 浓度：10, 100, 1000, 10000 nM
• 孵育时间：72 小时
• 结果：在所有三个细胞系中均显示出显著的细胞毒性效应。

蛋白质印迹分析

• 细胞系：A549 细胞
• 浓度：0.5, 5 μM
• 孵育时间：72 小时
• 结果：诱导 RASSF1A 蛋白表达。

RT-PCR 分析

• 细胞系：A549 细胞
• 浓度：5 μM
• 孵育时间：72 小时
• 结果：具有 18 倍的相对诱导量。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Dihydrokalafungin 在 ActVA-5 hydroxylase 、 ActVB hydroxylase 作用下， 生成 hemiactinorhodin 、 (1R,3S)-5,10-dihydroxy-1-methyl-6,9-dioxo-3,4,6,7,8,9-hexahydro-1H-naphtho[2,3-c]pyran-3-yl acetic acid
  参考文献：
  名称：

  揭示了两个连续的羟化反应：黄素依赖性单加氧酶催化的芳香化羟化反应，以进行肌动蛋白和相关抗生素的生物合成。

  摘要：

  黄素依赖性单加氧酶在生活系统中普遍存在，并分为单组分或两组分系统。由天蓝色链霉菌（Streptomyces coelicolor）产生的放线菌丝蛋白是一种代表性的多环聚酮化合物，其通过两组分ActVA-5 / ActVB羟化酶系统的作用而被羟基化。这些同源系统广泛分布在细菌中，但它们的反应机理仍不清楚。这项体外研究提供了通过参与放线菌ho素生物合成的羟基萘中间体两次连续羟基化的化学证据。ActVA-5加氧酶组分催化底物的逐步二羟基化，而ActVB黄素还原酶不仅提供了还原的辅因子，还调节了中间体的醌-氢醌互变。

  DOI：

  10.1002/cbic.201900490
• 作为产物：
  描述：

  (11S,15R,17R)-4-hydroxy-17-methyl-12,16-dioxatetracyclo[8.7.0.03,8.011,15]heptadeca-1(10),3(8),4,6-tetraene-2,9,13-trione 生成 Dihydrokalafungin
  参考文献：
  名称：

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Enantiodivergent Total Syntheses of Nanaomycins and Their Enantiomers, Kalafungins
  作者：Kuniaki Tatsuta、Kohji Akimoto、Masahiko Annaka、Yutaka Ohno、Mitsuhiro Kinoshita

  DOI：10.1246/bcsj.58.1699

  日期：1985.6

  The first, enantiospecific total syntheses of pyranonaphthoquinone antibiotics, nanaomycins D and A, and their enantiomers, kalafungin and 4-deoxykalafunginic acid are described by an “enantiodivergent” strategy from a common optically active intermediate, (1S,3RS,4S)-3,4-dihydro-5,9,10-trimethoxy-1-methyl-1H-naphtho[2,3-c]pyran-3,4-diol, which has been derived from L-rhamnose via condensation of

  第一个，吡喃萘醌抗生素，nanaomycins D 和 A 及其对映异构体，kalafungin 和 4-deoxykalafunginic 酸的对映特异性全合成是通过来自常见光学活性中间体 (1S,3RS,4S)-3 的“对映发散”策略描述的， 4-dihydro-5,9,10-trimethoxy-1-methyl-1H-naphtho[2,3-c]pyran-3,4-diol，由L-鼠李糖通过4-甲氧基-3缩合得到(苯基磺酰基)-1(3H)-异苯并呋喃酮和甲基 3,4,6-三脱氧-α-L-甘油-己基-3-烯吡喃糖苷-2-酮糖。
• Epoxyquinone Formation Catalyzed by a Two-Component Flavin-Dependent Monooxygenase Involved in Biosynthesis of the Antibiotic Actinorhodin
  作者：Takaaki Taguchi、Susumu Okamoto、Kimiko Hasegawa、Koji Ichinose

  DOI：10.1002/cbic.201100571

  日期：2011.12.16

  Additional epoxidation: A two‐component flavin‐dependent monooxygenase, the ActVA‐ORF5/ActVB system, functioning as a quinone‐forming C‐6 oxygenase for actinorhodin biosynthesis in Streptomyces coelicolor, was revealed to have an additional epoxidation activity in vitro. This additional function is possibly a result of the adaptable structural features of the two‐component system.

  额外的环氧化作用：揭示了一种两组分黄素依赖性单加氧酶ActVA-ORF5 / ActVB系统，可在腔肠链霉菌中作为肌动蛋白的生物合成中的醌形成C-6加氧酶，在体外具有额外的环氧化活性。该附加功能可能是两组分系统具有适应性的结构特征的结果。
• YAMAGUCHI, MASAHIKO;NAKAMURA, SHIGEO;OKUMA, TADASHI;MINAMI, TORU, TETRAHEDRON LETT., 31,(1990) N7, C. 3913-3916
  作者：YAMAGUCHI, MASAHIKO、NAKAMURA, SHIGEO、OKUMA, TADASHI、MINAMI, TORU

  DOI：——

  日期：——
• ——
  作者：UMEHDZAVA XAMAO、 TAKEHUTI TOMIO、 KAMEHDA KUNIAKI、 AKIMOTO ISADZI

  DOI：——

  日期：——
• Unveiling Two Consecutive Hydroxylations: Mechanisms of Aromatic Hydroxylations Catalyzed by Flavin‐Dependent Monooxygenases for the Biosynthesis of Actinorhodin and Related Antibiotics
  作者：Makoto Hashimoto、Takaaki Taguchi、Kazuki Ishikawa、Ryuichiro Mori、Akari Hotta、Susumu Watari、Kazuaki Katakawa、Takuya Kumamoto、Susumu Okamoto、Koji Ichinose

  DOI：10.1002/cbic.201900490

  日期：2020.3.2

  Flavin-dependent monooxygenases are ubiquitous in living systems and are classified into single- or two-component systems. Actinorhodin, produced by Streptomyces coelicolor, is a representative polycyclic polyketide that is hydroxylated through the action of the two-component ActVA-5/ActVB hydroxylase system. These homologous systems are widely distributed in bacteria, but their reaction mechanisms

  黄素依赖性单加氧酶在生活系统中普遍存在，并分为单组分或两组分系统。由天蓝色链霉菌（Streptomyces coelicolor）产生的放线菌丝蛋白是一种代表性的多环聚酮化合物，其通过两组分ActVA-5 / ActVB羟化酶系统的作用而被羟基化。这些同源系统广泛分布在细菌中，但它们的反应机理仍不清楚。这项体外研究提供了通过参与放线菌ho素生物合成的羟基萘中间体两次连续羟基化的化学证据。ActVA-5加氧酶组分催化底物的逐步二羟基化，而ActVB黄素还原酶不仅提供了还原的辅因子，还调节了中间体的醌-氢醌互变。