3-carbamoyl-1-((2R,3R,4S,5R)-5-((((((((2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-(6-(prop-2-yn-1-ylamino)-9H-purin-9-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)oxidophosphoryl)oxy)methyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)pyridin-1-ium | 1140909-81-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - （5'->5'）-二核苷酸
• 英文名称: 3-carbamoyl-1-((2R,3R,4S,5R)-5-((((((((2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-(6-(prop-2-yn-1-ylamino)-9H-purin-9-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)oxidophosphoryl)oxy)methyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)pyridin-1-ium
• CAS: 1140909-81-4
• 化学式: C₂₄H₂₉N₇O₁₄P₂
• 分子量: 701.48
• InChiKey: RDYGTXTWACZRQU-YDKVLQLQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.18
• 重原子数：
  47.0
• 可旋转键数：
  13.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.46
• 拓扑面积：
  307.1
• 氢给体数：
  7.0
• 氢受体数：
  18.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-carbamoyl-1-((2R,3R,4S,5R)-5-((((((((2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-(6-(prop-2-yn-1-ylamino)-9H-purin-9-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)oxidophosphoryl)oxy)methyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)pyridin-1-ium 、 1-azidooxy-2-(2-(18F)fluoranylethoxy)ethane 在 copper(II) sulfate 、 sodium ascorbate 作用下， 反应 0.33h， 生成
  参考文献：
  名称：

  [18F] -SuPAR：放射性氟化探针，用于DNA损伤依赖性聚（ADP-核糖）聚合酶活性的非侵入性成像。

  摘要：

  聚（ADP核糖）聚合酶（PARP）酶在靶蛋白上产生聚（ADP核糖）翻译后修饰，具有一系列以DNA和细胞应激为中心的功能。PARP同工型1和2对DNA完整性的监视至关重要，并且是防止DNA断裂的基因组的第一线守护者。在这里，我们介绍了一种新型探针（[18F] -SuPAR），用于使用正电子发射断层扫描（PET）对PARP-1 / 2活性进行无创成像。[18F] -SuPAR是一种放射性氟化烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD）类似物，可以被PARP-1 / 2识别并掺入聚（ADP核糖）（PAR）的长支链聚合物中。talazoparib治疗抑制PARP-1 / 2后，体内放射性示踪剂吸收的减少支持了对PARP-1 / 2活性的测量，一种有效的PARP抑制剂，最近被FDA批准用于治疗乳腺癌，以及放射性示踪剂类似物和聚ADP核糖的离体共定位。使用[18F] -SuPAR，我们能够绘制乳腺癌和宫颈癌异种移植小鼠模型中放射治疗后PARP-1

  DOI：

  10.1021/acs.bioconjchem.9b00089

文献信息

• Clickable NAD Analogues for Labeling Substrate Proteins of Poly(ADP-ribose) Polymerases
  作者：Hong Jiang、Jun Hyun Kim、Kristine M. Frizzell、W. Lee Kraus、Hening Lin

  DOI：10.1021/ja101588r

  日期：2010.7.14

  proteins PARPs modify. Here we report clickable NAD analogues that can be used to label PARP substrate proteins. The clickable NAD analogues have a terminal alkyne group which allows the conjugation of fluorescent or affinity tags to the substrate proteins. Using this method, PARP-1 and tankyrase-1 substrate proteins were labeled by a fluorescent tag and visualized on SDS-PAGE gel. Using a biotin affinity

  聚 (ADP-核糖) 聚合酶 (PARP) 催化多个腺嘌呤二磷酸核糖 (ADP-核糖) 单位从烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 (NAD) 转移到底物蛋白质。人类有 17 个 PARP。已知几种 PARPs，如 PARP-1 和 Tankyrase-1，在 DNA 修复、转录、有丝分裂和端粒长度维持中发挥重要作用。为了在分子水平上更好地理解 PARPs 的功能，有必要了解 PARPs 修饰的底物蛋白。在这里，我们报告了可用于标记 PARP 底物蛋白的可点击 NAD 类似物。可点击的 NAD 类似物有一个末端炔基，它允许荧光或亲和标签与底物蛋白结合。使用这种方法，PARP-1 和tankyrase-1 底物蛋白被荧光标签标记并在SDS-PAGE 凝胶上可视化。使用生物素亲和标签，我们能够分离和鉴定总共 79 种蛋白质作为潜在的 PARP-1 底物。这些包括已知的 PARP-1 底物蛋白，包括组蛋白和异质