摘要:
我们描述了在 DNA 环境中进行的研究,以测试常见的荧光猝灭剂 dabcyl 如何与寡脱氧核苷荧光团 (ODF) 相互作用,ODF 是一种建立在 DNA 支架上的堆叠电子相互作用荧光团系统。我们测试了 20 种不同的四聚体 ODF 序列,这些序列包含与 DNA 寡聚体 3' 末端缀合的芘 (Y)、苯并芘 (B)、苝 (E)、二甲氨基芪 (D) 和间隔基 (S) 单体的不同组合和排序。该探针序列与 dabcyl 标记的互补链的杂交导致 20 个 ODF 序列中 85% 的荧光强烈猝灭。淬火的高效率也由它们在 2.1×10 4和 4.3×10之间的大 Stern-Volmer 常数 ( K SV ) 建立5 M -1,用游离的dabcyl猝灭剂测量。有趣的是,ODF 的淬灭显示出强烈的序列依赖性。这在 ODF 序列的字谜中尤为明显;例如,序列 BYDS 的K SV比具有相同染料成分的BSDY