5,6-Difluoro-1-β-D-ribofuronasylbenzimidazole | 78582-01-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 苯并咪唑核糖核苷和核糖核苷酸
• 英文名称: 5,6-Difluoro-1-β-D-ribofuronasylbenzimidazole
• 英文别名: Difluororibofuranosylbenzimidazole；(2R,3R,4S,5R)-2-(5,6-difluorobenzimidazol-1-yl)-5-(hydroxymethyl)oxolane-3,4-diol
• CAS: 78582-01-1
• 化学式: C₁₂H₁₂F₂N₂O₄
• 分子量: 286.235
• InChiKey: KGTUTCCDAKKABM-DDHJBXDOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  87.7
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5,6-Difluoro-1-β-D-ribofuronasylbenzimidazole 以5%的产率得到5,6-Difluoro-1-β-D-ribofuranosylbenzimidazole 3',5'-phosphate
  参考文献：
  名称：

  1-β-d-呋喃核糖基苯并咪唑3'，5'-磷酸酯的衍生物模拟腺苷3'，5'-磷酸酯（cAMP）和鸟苷3'，5'-磷酸酯（cGMP）的作用

  摘要：

  根据MNDO方法预测的性质，设计了一系列1-β-D-呋喃呋喃糖基苯并咪唑3'，5'-磷酸酯（cBIMP）的新类似物，并由取代的苯并咪唑合成。通过MNDO方法计算每个苯并咪唑碱基的偶极子向量以及HOMO和LUMO能量，并确定cBIMP衍生物的亲脂性。通常，cBIMP衍生物激活cAMP依赖性蛋白激酶I和II，并优先结合位点B，特别是对于II型激酶，其中2-三氟甲基-cBIMP和5,6-二氟-cBIMP表现出最高的位点选择性。每个cBIMP衍生物都可以刺激cGMP刺激的环磷酸二酯酶（cGS-PDE），其中5,6-二甲基-cBIMP与cGMP一样有效，并且还可以抑制cGMP抑制的磷酸二酯酶（cGI-PDE）。仅2-三氟甲基-cBIMP和Rp-硫代磷酸酯（cBIMPS）（赤道P = S）对cPDE的水解具有抗性。如果有的话，将Sp-硫代磷酸酯缓慢水解。除了表现出高亲脂性外，用于诱导细胞凋亡和抑制增殖

  DOI：

  10.1016/0008-6215(92)85050-a
• 作为产物：
  描述：

  (9ci)-5,6-二氟-1H-苯并咪唑 在 甲醇 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 氨 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 49.0h， 生成 5,6-Difluoro-1-β-D-ribofuronasylbenzimidazole
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and biological evaluation of benzo[d]imidazole derivatives as potential anti-cancer agents

  摘要：

  We herein report the synthesis, biological activity and structure-activity relationship of derivatives of 5,6-dichloro-1-beta-D-ribofuranosylbenzimidazole and benzo[d]imidazole. A lead compound 6o demonstrates potent anti-proliferative activity and the ability to induce cancer cell apoptosis. (C) 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2011.12.088

文献信息

• Chemo-Enzymatic Synthesis and Biological Evaluation of 5,6-Disubstituted Benzimidazole Ribo- and 2′-Deoxyribonucleosides
  作者：Jan Balzarini、Igor Mikhailopulo、Irina Konstantinova、Olga Selezneva、Ilja Fateev、Tamara Balashova、Svetlana Kotovskaya、Zoya Baskakova、Valery Charushin、Alexander Baranovsky、Anatoly Miroshnikov

  DOI：10.1055/s-0032-1317782

  日期：——

  Abstract A number of new 5,6-disubstituted benzimidazoles have been prepared and their substrate properties for recombinant E. coli purine nucleoside phosphorylase (PNP; the product of the deoD gene) in the transglycosylation reaction were investigated. The heterocyclic­ bases showed good substrate activity for PNP and the ribo- and 2′-deoxyribonucleosides were synthesized. The predominant (OMe and

  摘要 已经制备了许多新的5，6-二取代的苯并咪唑，并研究了它们在转糖基化反应中对重组大肠杆菌嘌呤核苷磷酸化酶（PNP；deoD基因的产物）的底物性质。杂环碱基对PNP具有良好的底物活性，并合成了核糖和2'-脱氧核糖核苷。观察到5-取代的6-氟-1-（-1- d-核呋喃呋喃糖基）苯并咪唑的主要（OMe和OEt）或排他的（O i -Pr，吗啉代和N-甲基哌嗪子）形成。区域异构体6-甲氧基，6-乙氧基或6-异丙氧基取代的1-（2-脱氧-β- d的形成在相应碱基的反式-2-脱氧核糖基化反应中观察到-（呋喃核糖基）-5-氟苯并咪唑。具有6-氟苯并咪唑的大体积5-取代基的区域异构N 1-核苷的主要或排他性指向可容纳这些基团的大肠杆菌PNP活性位点中的大疏水口袋。对合成核苷的生物学活性进行了研究，发现对多种DNA和RNA病毒没有抑制活性。该化合物也缺乏明显的细胞毒性。 已经制备了许多新的5，6-二取代的
• Benzimidazoles in the Reaction of Enzymatic Transglycosylation
  作者：Igor Mikhailopulo、Zygmunt Kazimierczuk、Anatoli Zinchenko、Vladimir Barai、Valeria Romanova、Ludmilla Eroshevskaya

  DOI：10.1080/15257779508012409

  日期：1995.5.1

  Substrate activity of a broad spectrum of derivatives of benzimidazole in the reaction of enzymatic ribo- and 2-deoxyribosylation catalyzed by purine nucleoside phosphorylase of whole cells of E. coli BMT-1D/1A has been studied. Guanosine or 2'-deoxyguanosine were used as glycosyl donors.
• Derivatives of 1-β-d-ribofuranosylbenzimidazole 3′,5′-phosphate that mimic the actions of adenosine 3′,5′-phosphate (cAMP) and guanosine 3′,5′-phosphate (cGMP)
  作者：Hans-Gottfried Genieser、Elisabeth Winkler、Elke Butt、Michaela Zorn、Susanne Schulz、Frank Iwitzki、Reinhold Störmann、Bernd Jastorff、Stein Ove Døskeland、Dagfinn Øgreid、Sandrine Ruchaud、Michel Lanotte

  DOI：10.1016/0008-6215(92)85050-a

  日期：1992.10

  A series of new analogues of 1-beta-D-ribofuranosylbenzimidazole 3',5'-phosphate (cBIMP) has been designed according to the properties predicted by the MNDO method, and synthesised from substituted benzimidazoles. Dipole vectors and HOMO and LUMO energies for each benzimidazole base were calculated by the MNDO method and the lipophilicities of the cBIMP derivatives were determined. In general, the

  根据MNDO方法预测的性质，设计了一系列1-β-D-呋喃呋喃糖基苯并咪唑3'，5'-磷酸酯（cBIMP）的新类似物，并由取代的苯并咪唑合成。通过MNDO方法计算每个苯并咪唑碱基的偶极子向量以及HOMO和LUMO能量，并确定cBIMP衍生物的亲脂性。通常，cBIMP衍生物激活cAMP依赖性蛋白激酶I和II，并优先结合位点B，特别是对于II型激酶，其中2-三氟甲基-cBIMP和5,6-二氟-cBIMP表现出最高的位点选择性。每个cBIMP衍生物都可以刺激cGMP刺激的环磷酸二酯酶（cGS-PDE），其中5,6-二甲基-cBIMP与cGMP一样有效，并且还可以抑制cGMP抑制的磷酸二酯酶（cGI-PDE）。仅2-三氟甲基-cBIMP和Rp-硫代磷酸酯（cBIMPS）（赤道P = S）对cPDE的水解具有抗性。如果有的话，将Sp-硫代磷酸酯缓慢水解。除了表现出高亲脂性外，用于诱导细胞凋亡和抑制增殖
• Synthesis and biological evaluation of benzo[d]imidazole derivatives as potential anti-cancer agents
  作者：Hamad M. Alkahtani、Abdullahi Y. Abbas、Shudong Wang

  DOI：10.1016/j.bmcl.2011.12.088

  日期：2012.2

  We herein report the synthesis, biological activity and structure-activity relationship of derivatives of 5,6-dichloro-1-beta-D-ribofuranosylbenzimidazole and benzo[d]imidazole. A lead compound 6o demonstrates potent anti-proliferative activity and the ability to induce cancer cell apoptosis. (C) 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.