{(1R,2R,3S,5R)-2-[(α-L-fucopyranosyl)oxy]-3,5-dimethylcyclohex-1-yl} 3-O-[sodium (1S)-1-carboxy-2-cyclohexylethyl]-β-D-galactopyranoside | 1361093-44-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 糖脂
• 英文名称: {(1R,2R,3S,5R)-2-[(α-L-fucopyranosyl)oxy]-3,5-dimethylcyclohex-1-yl} 3-O-[sodium (1S)-1-carboxy-2-cyclohexylethyl]-β-D-galactopyranoside
• 英文别名: sodium;(2S)-3-cyclohexyl-2-[(2R,3R,4S,5S,6R)-2-[(1R,2R,3S,5R)-3,5-dimethyl-2-[(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxycyclohexyl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxypropanoate
• CAS: 1361093-44-8
• 化学式: C₂₉H₄₉O₁₃*Na
• 分子量: 628.69
• InChiKey: YSGAAPQOOWOPEY-LOTCQGINSA-M

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.43
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.97
• 拓扑面积：
  208
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  {(1R,2R,3S,5R)-2-[(α-L-fucopyranosyl)oxy]-3,5-dimethylcyclohex-1-yl} 2-O-benzoyl-3-O-[sodium (1S)-1-carboxy-2-cyclohexylethyl]-β-D-galactopyranoside 在 lithium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 18.0h， 以80%的产率得到{(1R,2R,3S,5R)-2-[(α-L-fucopyranosyl)oxy]-3,5-dimethylcyclohex-1-yl} 3-O-[sodium (1S)-1-carboxy-2-cyclohexylethyl]-β-D-galactopyranoside
  参考文献：
  名称：

  E-选择素拮抗剂核心结构的预组织

  摘要：

  设计并合成了用于E-选择素拮抗剂的新型N-乙酰基-D-葡萄糖胺（Glc N Ac）模拟物。该模拟物由被岩藻糖部分的连接位置附近的烷基取代基取代的环己烷环组成。掺入E-选择素拮抗剂产生了测试化合物8和2'-苯甲酰化类似物21，在低微摩尔范围内表现出亲和力。通过使用饱和转移差异（STD）-NMR，可以证明亲和力的提高不是由于烷基取代基与目标蛋白E-选择素的疏水性接触，而是由于稳定了其拮抗剂的空间效应所致。生物活性构象。发现在远端位置含有甲基取代基的拮抗剂10和35的亲和力丧失（因此不能支持核心的稳定）进一步支持了该假设。最后，当含有两个甲基取代基的Glc N Ac模拟物（52和53使用），其中一个甲基位于岩藻糖连接位置附近，另一个位于较远位置，亲和力得以恢复。

  DOI：

  10.1002/chem.201102884

文献信息

• Pre-organization of the Core Structure of E-Selectin Antagonists
  作者：Daniel Schwizer、John T. Patton、Brian Cutting、Martin Smieško、Beatrice Wagner、Ako Kato、Céline Weckerle、Florian P. C. Binder、Said Rabbani、Oliver Schwardt、John L. Magnani、Beat Ernst

  DOI：10.1002/chem.201102884

  日期：2012.1.27

  substituent with the target protein E‐selectin, but rather from a steric effect stabilizing the antagonist in its bioactive conformation. The loss of affinity found for antagonists 10 and 35 containing a methyl substituent in a remote position (and therefore unable to support to the stabilization of the core) further supports this hypothesis. Finally, when a GlcNAc mimetic containing two methyl substituents

  设计并合成了用于E-选择素拮抗剂的新型N-乙酰基-D-葡萄糖胺（Glc N Ac）模拟物。该模拟物由被岩藻糖部分的连接位置附近的烷基取代基取代的环己烷环组成。掺入E-选择素拮抗剂产生了测试化合物8和2'-苯甲酰化类似物21，在低微摩尔范围内表现出亲和力。通过使用饱和转移差异（STD）-NMR，可以证明亲和力的提高不是由于烷基取代基与目标蛋白E-选择素的疏水性接触，而是由于稳定了其拮抗剂的空间效应所致。生物活性构象。发现在远端位置含有甲基取代基的拮抗剂10和35的亲和力丧失（因此不能支持核心的稳定）进一步支持了该假设。最后，当含有两个甲基取代基的Glc N Ac模拟物（52和53使用），其中一个甲基位于岩藻糖连接位置附近，另一个位于较远位置，亲和力得以恢复。