d-ibGp^.an | 104579-05-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核糖核苷3'-磷酸盐
• 英文名称: d-ibGp^.an
• CAS: 104579-05-7
• 化学式: C₂₈H₂₉ClN₅O₁₀P
• 分子量: 661.993
• InChiKey: MUHRSDFVVJAHQQ-ZASXEUSASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.09
• 重原子数：
  45.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  193.19
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  13.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  d-ibGp^.an 、 d-<(MeO)2Tr>bzm5Cp. 在 1-(均三甲苯基磺酰基)-4-硝基-1H-咪唑 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 1.0h， 以91%的产率得到d-<(MeO)2Tr>bzm⁵Cp^.ibGp^.an
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and properties of d(ATACGCGTAT) and its derivatives containing one and two 5-methylcytosine residues. Effect of the methylation on deoxyribonucleic acid conformation.

  摘要：

  为了阐明胞嘧啶甲基化对脱氧核糖核酸（DNA）构象的影响，我们采用改进的磷酸酯法合成了三种自互补的脱氧核糖核苷酸，即d(ATACGCGTAT)、d(ATACGm5CGTAT)和d(ATAm5CGm5 CGTAT)，并通过紫外光谱（UV）和圆二色光谱（CD）研究了它们的构象特性。两种修饰的十聚体对限制性内切酶 MluI（其识别序列为 ACGCGT）具有完全的抗性，而未修饰的十聚体则完全被该酶裂解。假定所有十聚体在 0.1 M NaCl 中都以 B 型双链存在。紫外-温度曲线表明，与未修饰的十聚体相比，修饰的十聚体双链对热扰动的稳定性略高，但其熔化过程的协同性明显较低。在各种盐条件下，包括 4M NaCl 和 6M CsF，所有三种十聚体都显示出相似的 CD 光谱，但在 -20°C 下的 8M NaClO4 中观察到的 CD 光谱有很大差异。在这些极端条件下，两种修饰的十聚体都被假定为 Z 形双链体，它们显示出相似的紫外光谱和 CD 温度曲线，与未修饰十聚体的曲线截然不同。

  DOI：

  10.1248/cpb.34.51