3'N-debenzoyl-3'N-Boc-3'C-dephenyl-3'C-(thiophen-3-yl)taxol | 160747-92-2

• 英文名称: 3'N-debenzoyl-3'N-Boc-3'C-dephenyl-3'C-(thiophen-3-yl)taxol
• 英文别名: [(1S,2S,3R,4S,7R,9S,10S,12R,15S)-4,12-diacetyloxy-1,9-dihydroxy-15-[(2R,3S)-2-hydroxy-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-3-thiophen-3-ylpropanoyl]oxy-10,14,17,17-tetramethyl-11-oxo-6-oxatetracyclo[11.3.1.03,10.04,7]heptadec-13-en-2-yl] benzoate
• CAS: 160747-92-2
• 化学式: C₄₃H₅₃NO₁₅S
• 分子量: 855.958
• InChiKey: AAFQGOVGXPPYMP-VCVYQWHSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.9
• 重原子数：
  60
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  259
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  16

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  10-脱乙酰基巴卡丁 III 在 吡啶 、 咪唑 、 cerium(III) chloride 、 氢氟酸 、 lithium hexamethyldisilazane 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 4.67h， 生成 3'N-debenzoyl-3'N-Boc-3'C-dephenyl-3'C-(thiophen-3-yl)taxol
  参考文献：
  名称：

  A structure-based design of new C2- and C13-substituted taxanes: tubulin binding affinities and extended quantitative structure–activity relationships using comparative binding energy (COMBINE) analysis

  摘要：

  我们合成了在巴卡丁核心的 C2 和 C13 位置进行修饰的十种新型紫杉醇，并通过实验测定了它们与哺乳动物微管蛋白的结合亲和力。设计策略的指导原则是：(i) 计算δ-微管蛋白的类固醇结合位点内碳、氮和氧探针的相互作用能量图；(ii) 前瞻性地使用基于结构的 QSAR（COMBINE）模型，该模型来自早期由 47 种同源类固醇组成的系列。事实证明，其中一种新化合物（CTX63）与微管蛋白的结合亲和力高于多西他赛，更新后的 COMBINE 模型为所研究的 57 种化合物中的 54 种提供了实验结合自由能与一组基于加权残基的配体与受体相互作用能之间的良好相关性。原始训练系列中的其余三个异常值的共同点是对结合自由能有很大的不利熵贡献，我们将其归因于紫杉烷在水溶液中的预组织构象不同于与管蛋白结合的构象。在显式水溶液中进行的溶液核磁共振实验和分子动力学模拟为这一提议提供了支持。我们的研究结果进一步揭示了这一类重要抗肿瘤药物与小管蛋白结合亲和力的决定因素，并为进一步合理调整结构铺平了道路。

  DOI：

  10.1039/c3ob40407b