(3aS,4S,6aR)-4-(5-bromo-pentyl)tetrahydrothieno[3,4-d]imidazol-2-one | 304439-23-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 噻吩并咪唑类化合物
• 英文名称: (3aS,4S,6aR)-4-(5-bromo-pentyl)tetrahydrothieno[3,4-d]imidazol-2-one
• 英文别名: (3aS,6aR)-4-(5-Bromopentyl)tetrahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-2(3H)-one；(3aS,4S,6aR)-4-(5-bromopentyl)-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-2-one
• CAS: 304439-23-4
• 化学式: C₁₀H₁₇BrN₂OS
• 分子量: 293.228
• InChiKey: UOEFYJDREUFJRJ-CIUDSAMLSA-N

物化性质

• 沸点：
  498.3±30.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.387±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.9
• 拓扑面积：
  66.4
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (3aS,4S,6aR)-4-(5-bromo-pentyl)tetrahydrothieno[3,4-d]imidazol-2-one 在 sodium azide 、 四丁基溴化铵 作用下， 以 水 、 甲苯 为溶剂， 反应 16.0h， 以84%的产率得到生物素-C5-叠氮
  参考文献：
  名称：

  Triazole biotin: a tight-binding biotinidase-resistant conjugate

  摘要：

  通过炔基生物素衍生物的 CuAAC 反应，所有生物素化蛋白质中的天然酰胺键都被三唑取代。结果表明，三唑连接的加合物对无处不在的水解酶生物素酶具有很强的抗性，并能以低 pM 范围的解离常数与阿维丁结合。实验证明，这种策略可用于生产一系列抗生物素酶的生物素-Gd-DOTA 造影剂。

  DOI：

  10.1039/c3ob41837e
• 作为产物：
  描述：

  D-生物素甲酯 在 吡啶 、 lithium aluminium tetrahydride 、 lithium bromide 作用下， 以 四氢呋喃 、 丁酮 为溶剂， 生成 (3aS,4S,6aR)-4-(5-bromo-pentyl)tetrahydrothieno[3,4-d]imidazol-2-one
  参考文献：
  名称：

  具有抗菌活性的生物素类似物是生物素蛋白连接酶的有效抑制剂。

  摘要：

  迫切需要开发新的抗生素来抵抗耐药细菌的繁殖，例如临床上重要的金黄色葡萄球菌。基本的多功能酶生物素蛋白连接酶（BPL）是新抗生素的潜在药物靶标之一。我们报告了一系列生物素类似物的合成和表征，这些生物素类似物具有针对来自金黄色葡萄球菌，大肠杆菌和智人的BPL的活性。鉴定出K i <100 nM的两种有效抑制剂对一组金黄色葡萄球菌临床分离株具有抗菌活性（MIC 2-16杯/ mL）。鉴定并表征了具有高配体效率和同工酶之间选择性> 20倍的化合物。抗菌作用方式显示为通过抑制BPL。BPL和抑制剂之间的双分子相互作用是通过表面等离振子共振研究和X射线晶体学确定的。这些发现为具有更高效力和选择性的第二代抑制剂和抗生素铺平了道路。

  DOI：

  10.1021/ml300106p

文献信息

• Reductive coupling of benzyl oxalates with highly functionalized alkyl bromides by nickel catalysis
  作者：Xiao-Biao Yan、Chun-Ling Li、Wen-Jie Jin、Peng Guo、Xing-Zhong Shu

  DOI：10.1039/c8sc00609a

  日期：——

  Coupling reactions involving non-sulfonated C–O electrophiles provide a promising method for forming C–C bonds, but the incorporation of functionalized or secondary alkyl groups remains a challenge due to the requirement for well-defined alkylmetal species. In this study, we report a reductive nickel-catalyzed cross-coupling of benzyl oxalates with alkyl bromides, using oxalate as a new leaving group

  涉及非磺化C-O亲电子试剂的偶联反应为形成C-C键提供了一种有前途的方法，但由于需要明确的烷基金属种类，官能化或仲烷基的掺入仍然是一个挑战。在这项研究中，我们报道了草酸苄酯与烷基溴的还原镍催化交叉偶联，使用草酸作为新的离去基团。各种高度官能化的烷基单元（例如官能团：烷基氯、醇、醛、胺、酰胺、硼酸酯、醚、酯、杂环、膦酸酯、张力环）被有效地结合在苄基位置。通过复杂生物活性化合物的后期修饰进一步证明了这种合成方法的实用性。初步的机理实验表明，该反应可能涉及自由基过程。
• Specifically targeted catalytic antagonists and uses thereof
  申请人：——

  公开号：US20040170618A1

  公开（公告）日：2004-09-02

  This invention provides chimeric molecules that are catalytic antagonists of a target molecule. The catalytic antagonists of this invention preferably comprise a targeting moiety attached to an enzyme that degrades the molecule specifically bound by the targeting moiety. The catalytic antagonists of this invention thus bind to a target recognized by the targeting moiety (e.g., a receptor) the enzyme component of the chimera then degrades all or part of the target. This typically results in a reduction or loss of activity of the target and release of the chimeric molecule. The chimeric molecule is then free to attack and degrade another target molecule.

  这项发明提供了催化拮抗剂的嵌合分子，该催化拮抗剂是目标分子的催化拮抗剂。该发明的催化拮抗剂优选包括连接到降解与靶向基团特异结合的酶的靶向基团。因此，该发明的催化拮抗剂结合到被靶向基团识别的目标（例如，受体），然后嵌合体的酶组分降解目标的全部或部分。这通常导致目标的活性减少或丧失，并释放出嵌合分子。然后，嵌合分子可以自由攻击和降解另一个目标分子。
• Design and synthesis of biotinylated Hexylselen as a probe to identify KGA allosteric inhibitors by a convenient biomolecular interaction assay
  作者：Wei Hou、Jinzhang Fang、Lin Su、Hengyu Ye、Benfang Helen Ruan

  DOI：10.1016/j.bmcl.2019.07.014

  日期：2019.9

  investigation its mechanism of action, we designed and synthesized its biotinylated derivative 2 as a novel probe. From commercially available starting material, 2 was obtained in 6 steps with 13.4% overall yield. It is notable that this practical synthetic route give a template for the preparation of unsymmetrical di-benzo[d][1,2]selenazol-3(2H)-ones. Based on probe 2, we developed a novel biomolecular

  Hexylselen是一种新型的亚微摩尔双KGA / GDH抑制剂，可有效抑制癌细胞，并具有最小的毒性。为了进一步研究其作用机理，我们设计并合成了其生物素化衍生物2作为新型探针。从市售原料中，经6个步骤得到2个，总收率为13.4％。值得注意的是，该实用的合成途径为制备不对称的二苯并[ d ] [1,2]硒烯唑-3（2 H）-酮提供了模板。基于探针2，我们开发了一种新颖的生物分子相互作用测定法，用于方便，可靠地测试KGA变构抑制剂，并通过竞争性实验证实，己基硒醚作为KGA的变构抑制剂，与BPTES具有相同的结合口袋，而与Ebselen没有相同的结合口袋。
• Molecular Recognition Studies on Naphthyridine Derivatives
  作者：José Carlos Iglesias-Sánchez、Dolores Santa María、Rosa M. Claramunt、José Elguero

  DOI：10.3390/molecules15031213

  日期：——

  The association constants Kb of three hosts I–III designed to have both enhanced hydrogen bonding donor strength and conformational preorganization with biotin analogues 1–5 are reported. 1H-NMR titrations under two different concentration conditions have been employed to determine the association constants Kb. A statistical analysis using a presence absence matrix has been applied to calculate the different contributions. Hydrogen bond interactions make naphthyridine derivatives II and III potent binders and effective receptors for (+)-biotin methyl ester (1), due to the complex stabilization by additional hydrogen bonds.

  报告了设计用于增强氢键供体强度和构象预组织的生物素类似物 1-5 的三种宿主 I-III 的关联常数 Kb。采用两种不同浓度条件下的 1H-NMR 滴定法来确定关联常数 Kb。使用存在缺失矩阵进行统计分析，计算出不同的贡献。氢键相互作用使萘啶衍生物 II 和 III 成为(+)-生物素甲酯 (1) 的强效结合剂和有效受体，这是因为额外的氢键使复合物稳定。
• Biotin Analogues with Antibacterial Activity Are Potent Inhibitors of Biotin Protein Ligase
  作者：Tatiana P. Soares da Costa、William Tieu、Min Y. Yap、Ondrej Zvarec、Jan M. Bell、John D. Turnidge、John C. Wallace、Grant W. Booker、Matthew C. J. Wilce、Andrew D. Abell、Steven W. Polyak

  DOI：10.1021/ml300106p

  日期：2012.6.14

  bacteria, such as clinically important Staphylococcus aureus. The essential multifunctional enzyme, biotin protein ligase (BPL), is one potential drug target for new antibiotics. We report the synthesis and characterization of a series of biotin analogues with activity against BPLs from S. aureus, Escherichia coli, and Homo sapiens. Two potent inhibitors with K i < 100 nM were identified with antibacterial

  迫切需要开发新的抗生素来抵抗耐药细菌的繁殖，例如临床上重要的金黄色葡萄球菌。基本的多功能酶生物素蛋白连接酶（BPL）是新抗生素的潜在药物靶标之一。我们报告了一系列生物素类似物的合成和表征，这些生物素类似物具有针对来自金黄色葡萄球菌，大肠杆菌和智人的BPL的活性。鉴定出K i <100 nM的两种有效抑制剂对一组金黄色葡萄球菌临床分离株具有抗菌活性（MIC 2-16杯/ mL）。鉴定并表征了具有高配体效率和同工酶之间选择性> 20倍的化合物。抗菌作用方式显示为通过抑制BPL。BPL和抑制剂之间的双分子相互作用是通过表面等离振子共振研究和X射线晶体学确定的。这些发现为具有更高效力和选择性的第二代抑制剂和抗生素铺平了道路。