5’-O-(4,4’dimethoxytrityl)-N6-(benzoyl)-3’-O-tert-butyldimethylsilyldeoxyadenosine | 146578-12-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5’-O-(4,4’dimethoxytrityl)-N6-(benzoyl)-3’-O-tert-butyldimethylsilyldeoxyadenosine
• 英文别名: N-[9-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxyoxolan-2-yl]purin-6-yl]benzamide
• CAS: 146578-12-3
• 化学式: C₄₄H₄₉N₅O₆Si
• 分子量: 771.988
• InChiKey: APJHFYQHDUYTDC-YXWIYCFASA-N

物化性质

• 密度：
  1.20±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.78
• 重原子数：
  56
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5’-O-(4,4’dimethoxytrityl)-N6-(benzoyl)-3’-O-tert-butyldimethylsilyldeoxyadenosine 在 吡啶 、 咪唑 、 sodium hydroxide 、 sodium tetrahydroborate 、 potassium tert-butylate 、 四丁基氟化铵 、 对甲苯磺酸 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 甲胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 氯仿 、 水 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 12.5h， 生成 (2R,3S,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2-ethynyl-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-ol
  参考文献：
  名称：

  4'-C-氰基-和4'-C-乙炔基-2'-脱氧嘌呤核苷的设计，高效合成和抗HIV活性。

  摘要：

  一些4'-C-乙炔基-2'-脱氧嘌呤核苷在一系列4'-C-取代的2'-脱氧核苷中显示出最有效的抗HIV活性，其4'-C取代基为甲基，乙基，乙炔基和以此类推。我们的假设是，它们在C-4'位的取代基越小，它们显示出的生物活性就越好。因此，取代基小于乙炔基的4'-C-氰基-2'-脱氧嘌呤核苷将具有更强的抗病毒活性。为了证明我们的假设，我们计划开发4'-C-氰基-2'-脱氧嘌呤核苷（4'-CNdNs）和4'-C-乙炔基-2'-脱氧嘌呤核苷（4'- EdNs）。因此，我们成功开发了六个2'的有效合成 -在2'-脱氧腺苷和2,6-二氨基嘌呤2'-脱氧核糖苷的糖部分的C-4'位置带有氰基或乙炔基的-脱氧嘌呤核苷。不幸的是，4'-C-氰基衍生物显示出较低的抗HIV-1活性，而两种4'-C-乙炔基衍生物表明其体内毒性很高。

  DOI：

  10.1081/ncn-120037508
• 作为产物：
  描述：

  4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 在 吡啶 、 咪唑 作用下， 反应 20.0h， 生成 5’-O-(4,4’dimethoxytrityl)-N6-(benzoyl)-3’-O-tert-butyldimethylsilyldeoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  含有桥联的非手性核苷酸间3'-氨基磷酸酯键的寡脱氧核苷酸的合成和选择性切割

  摘要：

  使用固相亚磷酰胺方法制备了包含非手性桥连的3'-氨基磷酸酯键3'-NH-PO-5'的自互补寡聚脱氧核苷酸十二聚体。通过温和的酸解可以选择性地完成PN键的切割。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)60176-4

文献信息

• [EN] CYCLIC DINUCLEOTIDES AS STING AGONISTS<br/>[FR] DINUCLÉOTIDES CYCLIQUES UTILISÉS EN TANT QU'AGONISTES DE STING
  申请人：JANSSEN BIOTECH INC

  公开号：WO2019118839A1

  公开（公告）日：2019-06-20

  Disclosed are compounds, compositions and methods for treating of diseases, syndromes, or disorders that are affected by the modulation of STING. Such compounds are represented by Formula (I) as follows: wherein B2,X2, R2a, R2b, R2c, Z-M-Y, Y1-M1Z1, B1, X1, R1a, R1b, R1c are as defined herein.

  揭示了一种通过调节STING来治疗受影响的疾病、综合征或紊乱的化合物、组合物和方法。这些化合物由以下式（I）表示：其中B2、X2、R2a、R2b、R2c、Z-M-Y、Y1-M1Z1、B1、X1、R1a、R1b、R1c如本文所定义。
• Enantiodivergent Formation of C–P Bonds: Synthesis of P-Chiral Phosphines and Methylphosphonate Oligonucleotides
  作者：Dongmin Xu、Nazaret Rivas-Bascón、Natalia M. Padial、Kyle W. Knouse、Bin Zheng、Julien C. Vantourout、Michael A. Schmidt、Martin D. Eastgate、Phil S. Baran

  DOI：10.1021/jacs.9b13898

  日期：2020.3.25

  Phosphorous Incorporation (PI, abbreviated Π) reagents for the modular, scalable, and stereospecific synthesis of chiral phosphines and methyl-phosphonate nucleotides are reported. Synthesized from trans-limonene oxide, this reagent class displays an unexpected reactivity profile and enables access to chemical space distinct from that of the Phosphorous-Sulfur Incorporation reagents previously disclosed

  报告了用于手性膦和甲基膦酸核苷酸的模块化、可扩展和立体特异性合成的磷结合 (PI，缩写为 Π) 试剂。该试剂类由反式柠檬烯氧化物合成，显示出意想不到的反应性特征，并能够进入与之前公开的磷硫结合试剂不同的化学空间。在这里，适应性强的磷 (V) 支架能够连续添加碳亲核试剂以产生各种对映纯 CP 构建块。将三个碳亲核试剂添加到 Π，然后进行立体有择还原，得到有用的 P-手性膦；引入而不是单个甲基揭示了甲基膦酸酯寡核苷酸前体的首次立体定向合成。虽然两种 Π 对映异构体都可用，
• [EN] COMPOUNDS COMPOSITIONS AND METHODS INCLUDING THERMALLY LABILE MOIETIES<br/>[FR] COMPOSÉS, COMPOSITIONS ET PROCÉDÉS COMPRENANT DES FRAGMENTS THERMIQUEMENT LABILES
  申请人：BIOSEARCH TECHNOLOGIES INC

  公开号：WO2015167620A1

  公开（公告）日：2015-11-05

  The present invention generally relates to compounds that include one or more thermally labile protecting groups, compositions including the compounds, methods of making the compounds and compositions and methods of using the compounds and compositions. In one aspect, the present invention is directed to a compound of the structure XO-CH2-SM-B-A. The substituent X is H, an acid labile protecting group, a solid support, -P(O-R1)NR2R3, - P(O)(OH)H, -P(O)(OR1)H, -P(O)(OH)2, -P(O)(OH)O-P(0)(OH)OP(O)(OH)2 or salts thereof. The substituent R1 is CNE (i.e., cyanoethyl), alkyl, or heteroalkyl and R2 and R3 are independently alkyl. The substituent SM is a sugar moiety or analogue thereof that is not a natural furanosyl, B is a base moiety or analogue thereof, and A is a moiety attached to a nitrogen on or in the base moiety of the structure -C(O)OR4, wherein R4 is tertiary alkyl.

  本发明通常涉及包括一个或多个热敏稳定保护基团的化合物，包括这些化合物的组合物，制备这些化合物和组合物的方法，以及使用这些化合物和组合物的方法。在一个方面，本发明涉及具有结构XO-CH2-SM-B-A的化合物。取代基X是H，酸敏稳定保护基团，固体支持，-P(O-R1)NR2R3，- P(O)(OH)H，-P(O)(OR1)H，-P(O)(OH)2，-P(O)(OH)O-P(0)(OH)OP(O)(OH)2或其盐。取代基R1是CNE（即氰基乙基），烷基或杂环烷基，R2和R3是独立的烷基。取代基SM是一种糖基或其类似物，不是天然的呋喃糖基，B是一种碱基或其类似物，A是连接到结构-C(O)OR4上的氮上的或内部的基团，其中R4是三级烷基。
• Synthesis and separation of diastereomers of <i>O</i>-(2,2,2-trifluoroethyl)-3′,5′-dinucleoside phosphates
  作者：Weide Luo、Elena Atrazheva、Nancy Fregeau、William H. Gmeiner、J. William Lown

  DOI：10.1139/v94-193

  日期：1994.6.1

  The synthesis, diastereomeric separation, and characterization are described for a series of novel O-(2,2,2-trifluoroethyl)-3′,5′-dinucleoside phosphates, required for incorporation into antisense probes in the magnetic resonance imaging investigation of biodistribution. Preliminary assignment of the absolute configuration of the Rp and Sp diastereomers is made on the basis of 31 P NMR spectra.

  描述了一系列新型 O-(2,2,2-三氟乙基)-3',5'-双核苷磷酸酯的合成、非对映体分离和表征，在生物分布的磁共振成像研究中需要纳入反义探针. Rp 和 Sp 非对映异构体的绝对构型的初步分配是基于 31 P NMR 光谱进行的。
• 亚磷酰胺化的核苷衍生物及其合成方法、应用和试剂盒
  申请人：上海兆维科技发展有限公司

  公开号：CN114315935A

  公开（公告）日：2022-04-12

  一种亚磷酰胺化的核苷衍生物及其合成方法、应用和试剂盒，属于寡聚核苷酸领域。合成方法包括：对起始物的羟基保护，碱基上的N6位氨基进行保护，然后脱除3′和5′羟基的保护，获得第一中间体；对第一中间体的5′和3′羟基进行保护，获得第二中间体；脱除第二中间体的5′羟基的保护基团，并通过甲氧基异丙基对5′羟基进行保护，获得第三中间体；依次脱除所述第三中间体中的3′羟基的和碱基上的N6位氨基的保护基团，获得第四中间体；对第四中间体的碱基上的N6位氨基进行亚胺化保护，3′羟基进行亚磷酰胺化保护。该方法具有实施方便、经济，可实现大规模生产的优点。