10-(5-(((2-cyanoethoxy)(diisopropylamino)phosphaneyl)oxy)pentyl)-5,5-difluoro-1,3,7,9-tetramethyl-5H-5l4-dipyrrolo[1,2-c:2',1'-f][1,3,2]diazaborinin-4-ium | 1274667-32-1

• 英文名称: 10-(5-(((2-cyanoethoxy)(diisopropylamino)phosphaneyl)oxy)pentyl)-5,5-difluoro-1,3,7,9-tetramethyl-5H-5l4-dipyrrolo[1,2-c:2',1'-f][1,3,2]diazaborinin-4-ium
• CAS: 1274667-32-1
• 化学式: C₂₇H₄₂BF₂N₄O₂P
• 分子量: 534.438
• InChiKey: OSXQSJYXEQSIHR-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  None
• 重原子数：
  None
• 可旋转键数：
  None
• 环数：
  None
• sp3杂化的碳原子比例：
  None
• 拓扑面积：
  None
• 氢给体数：
  None
• 氢受体数：
  None

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  6-溴己酰氯 在 lithium hydroxide monohydrate 、 水 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 81.75h， 生成 10-(5-(((2-cyanoethoxy)(diisopropylamino)phosphaneyl)oxy)pentyl)-5,5-difluoro-1,3,7,9-tetramethyl-5H-5l4-dipyrrolo[1,2-c:2',1'-f][1,3,2]diazaborinin-4-ium
  参考文献：
  名称：

  COMPOUNDS FOR FLUORESCENT LABELING

  摘要：

  本申请涉及到化合物的公式I：其中R1-R9，X，Y和Z如申请中所定义，并且涉及到化合物的公式I的用途，例如用于寡核苷酸的荧光标记。

  公开号：

  US20120071644A1

文献信息

• Oligonucleotide Labeling Using BODIPY Phosphoramidite
  作者：Kha Tram、Daniel Twohig、Hongbin Yan

  DOI：10.1080/15257770.2010.536798

  日期：2011.1.21

  4,4-Difluoro-4-bora-3a,4a-diaza-s-indacene (BODIPY) derivatives were prepared and their photochemical properties were characterized. One such analogue, 4,4-difluoro-4-bora-1,3,5,7-tetramethyl-8-(5-hydroxypentyl)-3a,4a-diaza-s-indacene was transformed into the corresponding phosphoramidite and incorporated into oligodeoxyribonucleotides as a fluorescent reporter group.