在生物信息学研究中，核酸序列数据是解码生命奥秘的核心，而数据库则是储存、管理这些数据的关键载体。其中，DDBJ（DNA Data Bank of Japan，日本 DNA 数据库）与 NCBI GenBank（美国）、ENA（欧洲核苷酸档案库）并称为全球三大核心核酸序列数据库，共同构成生信入门者必须掌握的基础数据资源体系。
作为亚洲地区首个综合性核酸数据库，DDBJ 不仅承担着亚太地区核酸数据的存储与共享重任，更以其独特的功能设计和友好的使用体验，成为生信初学者探索核酸世界的重要起点。今天就为大家详细介绍一下 DDBJ的使用方法！
一、DDBJ简介
DDBJ，全称为DNA Data Bank of Japan（日本DNA数据库），是生命科学领域全球公认的三大核心公共核酸序列数据库之一，成立于1986年，由日本国立遗传学研究所（National Institute of Genetics, NIG）负责运营与维护，由Japanese Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology (MEXT)提供资助。
数据库主页http://www.ddbj.nig.ac.jp/index-e.html
该数据库的核心宗旨在于为国际科研群体提供一个稳定、可靠且免费开放的核酸序列数据存储、管理与共享平台，旨在有效推动生命科学研究的进展与突破。
为实现核酸序列数据的全球性整合与即时共享，DDBJ与美国国家生物技术信息中心（NCBI）管理的GenBank以及欧洲生物信息研究所（EBI）运营的ENA（European Nucleotide Archive）共同组建了“国际核苷酸序列数据库合作联盟”（International Nucleotide Sequence Database Collaboration，INSDC）。
这三个权威数据库之间建立了高效协同的工作机制，确保每日进行数据的交换与同步。这种深度协作保障了全球用户所访问数据库内容的实时性、完整性和全球一致性，为科研人员无论身处何地进行序列查询、深度分析及规范引用，提供了坚实的全球性基础设施支持。
二、使用方法
数据库网址：https://www.ddbj.nig.ac.jp/index-e.html
检索界面：
DDBJ的核心职能是系统性地收集、整理并长期归档所有公开的核酸序列数据资源，涵盖DNA与RNA序列。尤为关键的是，它同时储存了与之紧密关联的丰富注释信息，包括但不限于物种来源、基因结构定位、编码蛋白信息、功能预测依据、实验获取方法及相关文献引用等。
为确保数据的质量与规范性，所有提交至DDBJ的数据须遵循严格的格式标准，并经由专业人员进行审核流程。所有数据均无偿开放获取，其中每条记录均分配有全球唯一的永久性登录号（Accession Number），极大地方便了科研人员的研究引用与后续分析工作。
序列文件.DAD格式为带有注释的文件
DBJ主要向研究者收集DNA序列信息并赋予其数据存取号，信息来源主要是日本的研究机构，亦接受其他国家呈递的序列，数据库通过WWW环球网，匿名FTP，e-mail或Gopher方式为广大研究人员服务。
三、FTP下载
DDBJ包含所有INSDC共享的FASTA格式序列数据（含专利序列），具体有原始序列、基因组序列、高通量测序矩阵、DRA（DNA Data Bank of Japan Sequence Read Archive）、转录组集成库、TSA（Transcriptome Shotgun Assembly）。
科研工作者可通过其官方网站便捷访问DDBJ的全部数据资源与服务功能，网站提供完善的检索界面及详细技术文档支持。针对大规模数据分析需求，平台亦提供标准化的FTP数据下载服务。
总而言之，凭借其严格的数据治理机制、强大的生物信息学工具集、多元化的专业数据库体系以及不可或缺的全球协作网络，DDBJ在国际科学数据共享生态中具有战略地位，是生命科学研究者不可或缺的重要工具与研究宝库。
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