在生物信息学的广阔天地里，选对工具能让科研效率大幅提升。今天，要给大家重磅推荐一款在分子克隆领域备受青睐的生信软件 ——SnapGene。它功能强大、操作便捷，无论是构建质粒图谱、分析酶切位点，还是设计引物，都能轻松应对。接下来，就为大家全方位揭秘 SnapGene 的使用方法。
一、ChEBI 数据库简介
SnapGene 是一款深受分子生物学研究者依赖的基因编辑软件，由GSL Biotech公司开发，它可以帮助科研小伙伴们更轻松地进行基因组编辑和研究。SnapGene软件支持多种基因编辑工具，包括CRISPR/Cas9、TALEN、ZFN等，还包含了序列编辑和标记、质粒图谱构建、酶切位点分析、序列比对等多种功能，可以满足不同生物学研究人员对相应序列进行分析的操作。
名称中虽有“编辑”二字，其核心能力却不在于模仿 CRISPR-Cas9 在活细胞内进行的直接编辑。相反，它扮演的是“虚拟实验台”的角色，科学家借助它能在计算机上完成复杂基因实验从概念构思（设计）、结果预演（模拟）、数据直观呈现（可视化）到方案优化（规划）的全套前期工作。
二、SnapGene下载安装
SnapGene 官网（https://www.snapgene.cn/）可申请免费试用；网络上也有大量该软件的资源可供获取，需要的小伙伴可进行搜索获取下载。
安装教程如下：
1. 下载安装包并解压，双击“snapgene_4.2.4_win.exe”完成安装；
2. 把“Crack”文件夹下的 “ActivationCrack.exe” 复制到已安装的SnapGene目录下，右键管理员权限打开，点击yes，点击“Patch And Register”生成注册信息；
3. 将“SnapGene.exe”替换到已安装的SnapGene目录下完成破解；
4. 安装结束。
三、SnapGene部分功能介绍
3.1 查看质粒图谱，以pET32a(+)为例
a. 选择图谱类型
b. 显示质粒的标签
c. 完整图谱
3.2 功能栏
其中最主要用到的有以下几个功能：
酶切位点可视化（Show Enzymes）
一点开这个功能，序列图谱上的限制酶切位点瞬间点亮成高亮状态。深黑色标注的是那些珍贵的一次性切割位点（全序列里独此一处），浅色标记的则是能多位置下手的常见酶。下拉菜单里藏了个实用技能——反查当前序列缺乏的酶切位点，顺手还能把识别序列一起调出来看。搞克隆方案设计时，这个功能绝对是筛选核心工具酶的首选。
功能区显影开关（Show Features）
这个开关掌控着启动子、终止子、结构域这些注释标签的隐身术。碰到全基因组或多基因载体这类复杂图谱时尤为救命，功能区标注挤作一团时点它，视野瞬间清爽。特别要分析某个特定元件时，直接屏蔽干扰信息就对了。
翻译扫描仪（Show Translation）
它主要负责扫描潜在的开放阅读框（ORFs），底下藏着可调节的预测参数（比如最小ORF尺寸、起始密码子倾向性）。我们在追踪lncRNA或circRNA里暗藏的小肽编码区时经常启用它——当然扫出来的这些潜在区域，最后还得靠进化保守性分析或核糖体印记实验这些硬核手段验明正身。
氨基酸代码转换器（Use 3 Letter Codes）
勾选之后，序列翻译区立刻从单字母模式（像D、K）切到三字母标准命名（Asp、Lys）。在比对相似氨基酸序列时优势明显，比如Asn和Asp这种字母缩写形式容易混淆的组合（Asx），展开成完整名称立马界限分明。这个显示方式完全遵循IUPAC-IUB的生化命名规范（参考：NCBI氨基酸代码表）。
3.3 多序列比较
如下图，选择需要比对的序列文件进行同源性比较：
比对结果如下图，原始序列在第一条，比对序列按照添加顺序排列，所有序列的非同源部分以空白显示，同源区域以第一个基因开始，与原始序列重合显示。
四、结语
SnapGene 功能远不止于此，还有更多高级功能等待大家去探索和挖掘。这款软件功能多种多样设计gRNA并预测脱靶效应，例如引物设计、PCR程序构建、重组质粒的设计、模拟克隆、设计gRNA并预测脱靶效应等等，这些功能我们会在后续一一为大家介绍，期待我们下期再会！
【免责声明】发布内容来源于互联网、业内人士投稿以及微信公众号等公开资源，我们对文中观点持中立态度，文中观点不代表本平台的立场。所有文章仅供读者参考和交流使用。转载的文章版权归原作者所有，如有侵权行为，请及时与我们联系以便删除。
