5'-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-3'-O-dephosphinicothymidylyl[3-(anthracen-9-ylmethyl)-12-(2,2,2-trifluoroacetyl)-6,9-dioxa-3,12-diazatetradecane-1,14-diyl]-(3'-5')-thymidine 3'-(2-cyanoethyl N,N-diisopropylphosphoroamidite) | 1000169-52-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-3'-O-dephosphinicothymidylyl[3-(anthracen-9-ylmethyl)-12-(2,2,2-trifluoroacetyl)-6,9-dioxa-3,12-diazatetradecane-1,14-diyl]-(3'-5')-thymidine 3'-(2-cyanoethyl N,N-diisopropylphosphoroamidite)
• 英文别名: N-[2-[2-[2-[anthracen-9-ylmethyl-[2-[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxyethyl]amino]ethoxy]ethoxy]ethyl]-N-[2-[[(2R,3S,5R)-3-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy]ethyl]-2,2,2-trifluoroacetamide
• CAS: 1000169-52-7
• 化学式: C₇₇H₉₂F₃N₈O₁₆P
• 分子量: 1473.59
• InChiKey: MGOPCFWIRCXBHG-LBGVSLKRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.3
• 重原子数：
  105
• 可旋转键数：
  38
• 环数：
  10.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  251
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  22

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5'-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-3'-O-dephosphinicothymidylyl[3-(anthracen-9-ylmethyl)-12-(2,2,2-trifluoroacetyl)-6,9-dioxa-3,12-diazatetradecane-1,14-diyl]-(3'-5')-thymidine 、 双(二异丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦 在 二异丙基铵盐四氮唑 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 5'-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-3'-O-dephosphinicothymidylyl[3-(anthracen-9-ylmethyl)-12-(2,2,2-trifluoroacetyl)-6,9-dioxa-3,12-diazatetradecane-1,14-diyl]-(3'-5')-thymidine 3'-(2-cyanoethyl N,N-diisopropylphosphoroamidite)
  参考文献：
  名称：

  带有长链接头的寡脱氧核苷酸的合成和杂交特性

  摘要：

  在其主链的长链连接基（6,9-二氧杂-3,12- diazatetradecane -1,14-二基）新合成寡核苷酸，并可以通过测量进行了研究其杂交性质Ť米曲线和荧光光谱。所述Ť米分析表明，这些寡核苷酸可以结合它们的互补链，尽管长链连接基的存在。我们还证明了在长链接头中两个N原子之一上具有蒽9-基甲基的寡聚脱氧核苷酸的有趣荧光性质。这些寡核苷酸与互补链杂交后，其荧光强度增加，并且对特定位置错配碱基对的存在敏感。

  DOI：

  10.1002/hlca.200790203