boc-Orn(Z)-Leu-D-Phe-Pro-OBzl | 96099-73-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: boc-Orn(Z)-Leu-D-Phe-Pro-OBzl
• 英文别名: Boc-Orn(Cbz)-Leu-D-Phe-Pro-OBn；benzyl (2S)-1-[(2R)-2-[[(2S)-4-methyl-2-[[(2S)-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-5-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoyl]amino]pentanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxylate
• CAS: 96099-73-9
• 化学式: C₄₅H₅₉N₅O₉
• 分子量: 813.992
• InChiKey: DSKSIWSEEYTQON-DYLMPHRMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.8
• 重原子数：
  59
• 可旋转键数：
  23
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  182
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  boc-Orn(Z)-Leu-D-Phe-Pro-OBzl 在 盐酸 、 1-羟基苯并三唑 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 生成 Boc-D-Phe-Val-Orn(Z)-Leu-D-Phe-Pro-OBzl
  参考文献：
  名称：

  含有 Pro-D-Phe 序列代替抗生素 β-Turn 部分中 D-Phe-Pro 序列的短杆菌肽 S 类似物的合成和性质

  摘要：

  合成了两种短杆菌肽 S 类似物 [L-Pro4, D-Phe5]-短杆菌肽 S 和 [L-Pro4,4', D-Phe5,5']-短杆菌肽 S，以研究 Pro 位置之间的关系残留物、抗生素活性和 CD 谱。[L-Pro4,4', D-Phe5,5']-短杆菌肽 S 几乎没有活性。另一方面，[L-Pro4, D-Phe5]-短杆菌肽S对枯草杆菌和黄微球菌的活性与短杆菌肽S相同，对其他微生物的活性是短杆菌肽S的1/2这些类似物和短杆菌肽S在水溶液中的CD谱互不相同，说明这些肽在水溶液中具有不同的构象。[L-Pro4, D-Phe5]-短杆菌肽 S 的 CD 光谱类似于短杆菌肽 S 和 [L-Pro4,4', D-Phe5,5']-短杆菌肽 S 的 CD 光谱的图形平均值。

  DOI：

  10.1246/bcsj.58.1469
• 作为产物：
  描述：

  Boc-D-苯丙氨酸 在 盐酸 、 1-羟基苯并三唑 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 生成 boc-Orn(Z)-Leu-D-Phe-Pro-OBzl
  参考文献：
  名称：

  含有 Pro-D-Phe 序列代替抗生素 β-Turn 部分中 D-Phe-Pro 序列的短杆菌肽 S 类似物的合成和性质

  摘要：

  合成了两种短杆菌肽 S 类似物 [L-Pro4, D-Phe5]-短杆菌肽 S 和 [L-Pro4,4', D-Phe5,5']-短杆菌肽 S，以研究 Pro 位置之间的关系残留物、抗生素活性和 CD 谱。[L-Pro4,4', D-Phe5,5']-短杆菌肽 S 几乎没有活性。另一方面，[L-Pro4, D-Phe5]-短杆菌肽S对枯草杆菌和黄微球菌的活性与短杆菌肽S相同，对其他微生物的活性是短杆菌肽S的1/2这些类似物和短杆菌肽S在水溶液中的CD谱互不相同，说明这些肽在水溶液中具有不同的构象。[L-Pro4, D-Phe5]-短杆菌肽 S 的 CD 光谱类似于短杆菌肽 S 和 [L-Pro4,4', D-Phe5,5']-短杆菌肽 S 的 CD 光谱的图形平均值。

  DOI：

  10.1246/bcsj.58.1469

文献信息

• Studies on Peptide Antibiotic “Gratisin”
  作者：Makoto Tamaki

  DOI：10.1246/bcsj.57.3210

  日期：1984.11

  According to a primary structure proposed for an antibiotic peptide, gratisin, four peptides containing respectively partial sequences, l-Phe–l-Pro–l-Tyr, d-Phe–l-Pro–l-Tyr, l-Phe–l-Pro–d-Tyr, and d-Phe–l-Pro–d-Tyr, were synthesized by a liquid phase method. Among them, cyclo(–l-Val–l-Orn–l-Leu–d-Phe–l-Pro–d-Tyr–)2 showed the strongest activity against the Gram-positive microorganisms tested. The activity toward Bacillus subtilis was similar to that of gramicidin S. Therefore, it is quite possible that natural gratisin is identical to this peptide. To facilitate a further investigation of the structure-activity relationship, four additional analogs were prepared. The results of their antibiotic activities showed that an interchange of d-Phe residues with d-Tyr residues caused the decrease of activity, and that the hydroxyl group of d-Tyr residues had no important role in this activity. The peptides possessing partial sequences, d-Phe–d-Tyr–l-Pro and l-Pro–d-Phe–d-Phe, exhibited strong activity. These facts show that the positions of Pro residues are not restricted to 5 and 5′ for the exhibition of the activity. The CD spectra of these synthetic peptides in an aqueous solution reflected the partial sequences around Pro residues, which affect largely the conformation of these synthetic antibiotics. The temperature dependence of these CD spectra indicated that the conformation of biologically active peptides is more stable than those of less active peptides.

  根据为抗生素多肽格拉亭拟订的一个主要结构，用液相法合成了分别含有部分序列l-苯丙–l-脯–l-酪、d-苯丙–l-脯–l-酪、l-苯丙–l-脯–d-酪和d-苯丙–l-脯–d-酪的四个多肽。其中环(–l-缬–l-鸟–l-亮–d-苯丙–l-脯–d-酪–)2 对所试的革兰氏阳性微生物表现最强的活性。它对枯草杆菌的活性与短杆菌肽 S的相似。因此，天然格拉亭与这个多肽很可能就是同一个东西。为了便于进一步探讨结构与活性关系，制备了四个别的类似物。从它们的抗生素活性的结果看出，把 d-苯丙残基换成d-酪残基会使活性降低，而 d-酪残基的羟基对此活性没有重要作用。具有部分序列 d-苯丙–d-酪–l-脯和 l-脯–d-苯丙–d-苯丙的各个多肽表现很强的活性。这些情况说明，脯残基的位置并不是非固定在5 及 5'不可才表现出活性。这些合成多肽在溶液中的圆二色性光谱反映了脯残基周围的部分序列，它们对这些合成抗生素的构象有很大影响。这些圆二色性光谱的温度依赖关系指出，有生物活性的多肽的构象比活性较小的多肽的构象更稳定些。
• Studies of a Peptide Antibiotic “Gratisin”. II
  作者：Makoto Tamaki、Michiaki Takimoto、Ichiro Muramatsu

  DOI：10.1246/bcsj.60.2101

  日期：1987.6

  In order to investigate the structure-activity relationship of the “gratisin”-related peptide, cyclo(–Val–Orn–Leu–d-Phe–Pro–d-Tyr–)2 (GR-I), its two analogs, cyclo(–Val–Orn–Leu–d-Ala–Pro–d-Tyr–)2 (6a) and cyclo(–Val–Orn–Leu–d-Phe–Pro–d-Ala–)2 (6b), were synthesized. The CD spectra of these synthetic peptides in an aqueous solution were similar to that of GR-I, indicating that these peptides have similar conformations in an aqueous solution. The activity of 6b was half that of GR-I, whereas 6a did not show any antibiotic activity. These results indicated that the phenyl group of the d-Phe residue preceding the Pro residue is essential for exhibiting the activity, while the p-hydroxyphenyl group of the d-Tyr residue following the Pro residue is not essential.

  为了研究 "gratisin "相关多肽环(-Val-Orn-Leu-d-Phe-Pro-d-Tyr-)2（GR-I）的结构-活性关系，合成了其两个类似物环(-Val-Orn-Leu-d-Ala-Pro-d-Tyr-)2 (6a)和环(-Val-Orn-Leu-d-Phe-Pro-d-Ala-)2 (6b)。这些合成肽在水溶液中的 CD 光谱与 GR-I 相似，表明这些肽在水溶液中具有相似的构象。6b 的活性是 GR-I 的一半，而 6a 则没有显示出任何抗生素活性。这些结果表明，Pro残基之前的d-Phe残基的苯基是显示活性的必要条件，而Pro残基之后的d-Tyr残基的对羟基苯基则不是必要条件。
• Natural Homologs of Gramicidin S. II. Synthesis of Gramicidin S-2 and S-3
  作者：Sukekatsu Nozaki、Ichiro Muramatsu

  DOI：10.1246/bcsj.58.331

  日期：1985.1

  corresponding to newly found members of gramicidin S family, gramicidin S-2: cyclo(–Val–Orn–Leu–D-Phe–Pro–Abu–Orn–Leu–D-Phe–Pro–), and gramicidin S-3: cyclo(–Abu–Orn–Leu-D-Phe–Pro–Abu–Orn–Leu–D-Phe–Pro–), were synthesized. In the synthesis, the linear decapeptide precursors of the antibiotics prepared by a combination of the “hold-in-solution” method and the usual liquid phase method were converted to cyclic ones

  两种环状十二肽对应于新发现的短杆菌肽 S 家族成员，短杆菌肽 S-2：环（-Val-Orn-Leu-D-Phe-Pro-Abu-Orn-Leu-D-Phe-Pro-）和短杆菌肽 S -3：合成了环（–Abu–Orn–Leu-D-Phe–Pro–Abu–Orn–Leu–D-Phe–Pro–）。在合成中，通过“保持溶液”法和通常的液相法相结合制备的抗生素的线性十肽前体通过使用 1-乙基-3 的一锅反应以优异的产率转化为环状前体。 -(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺盐酸盐和1-羟基苯并三唑。合成的抗生素在HPLC分析和抗生素活性测定中与天然产物相同。短杆菌肽 S-2 和 S-3 的拟议结构得到证实。
• Synthesis and Properties of Gramicidin S Analogs Consisting of Eight Amino Acid Residues
  作者：Makoto Tamaki、Sadatoshi Akabori

  DOI：10.1246/bcsj.64.2569

  日期：1991.8

  Three cyclic octapeptides (des-Val1,1′-gramicidin S, des-Leu3,3′-gramicidin S and des-Val1, Leu3′-gramicidin S), showed no antibiotic activity. Although their CD spectra resembled each other, they differed from that of gramicidin S. These results indicate that the removal of two of the Val and/ or Leu residues at positions 1, 1′, 3, and 3′ of gramicidin S greately affects both the antibiotic activity

  三种环状八肽（des-Val1,1'-短杆菌肽 S、des-Leu3,3'-短杆菌肽 S 和 des-Val1、Leu3'-短杆菌肽 S）均未显示抗生素活性。尽管它们的 CD 光谱彼此相似，但它们与短杆菌肽 S 的不同。这些结果表明，去除短杆菌肽 S 的 1、1'、3 和 3' 位上的两个 Val 和/或 Leu 残基极大地影响了两者抗生素活性和构象。