6-苄基腺苷 | 4294-16-0

• 物质功能分类: 生物化工 - 核苷类药物 - 核苷中间体
• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 中文名称: 6-苄基腺苷
• 中文别名: 6-苄基氨基嘌呤核糖甙；6-苄氨基嘌呤核苷
• 英文名称: N6-Benzyladenosine
• 英文别名: (2R,3R,4S,5R)-2-(6-(benzylamino)-9H-purin-9-yl)-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3,4-diol；6-benzylaminopurine riboside；(4S,2R,3R,5R)-2-hydroxymethyl-5-[6-(benzylamino)-purin-9-yl]-tetrahydrofuran-3,4-diol；(2R,3R,4S,5R)-2-[6-(benzylamino)purin-9-yl]-5-(hydroxymethyl)oxolane-3,4-diol
• CAS: 4294-16-0
• 化学式: C₁₇H₁₉N₅O₄
• 分子量: 357.369
• InChiKey: MRPKNNSABYPGBF-LSCFUAHRSA-N

物化性质

• 熔点：
  184-186 °C
• 沸点：
  490.01°C (rough estimate)
• 密度：
  1.1786 (rough estimate)
• 溶解度：
  DMSO（微溶）、甲醇（微溶、超声处理）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.1
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  126
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

安全信息

• 危险品标志：
  Xn
• 安全说明：
  S22,S24/25
• 危险类别码：
  R20/21/22,R36/37/38
• WGK Germany：
  3
• 海关编码：
  29349990
• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335

制备方法与用途

应用：6-苄基腺苷可作为医药合成中的重要中间体。

上下游信息

• 上游原料

  中文名称	英文名称	CAS号	化学式	分子量
  腺苷	adenosine	58-61-7	C10H13N5O4	267.244
  ——	N6-benzyladenylyl(2'-5')-N6-benzyladenylyl(2'-5')-N6-benzyladenosine	193898-79-2	C51H55N15O16P2	1196.04
  2',3',5'-三乙酰腺苷	triacetyladenosine	7387-57-7	C16H19N5O7	393.356
  肌苷	inosine	58-63-9	C10H12N4O5	268.229
  6-氯嘌呤核苷	6-Chloropurine riboside	5399-87-1	C10H11ClN4O4	286.675
  鸟苷	GUANOSINE	118-00-3	C10H13N5O5	283.244
  ——	6-(1H-imidazol-1-yl)-9-(β-D-ribofuranosyl)purine	309253-78-9	C13H14N6O4	318.292
  2,3,5-三-O-乙酰基-6-氯嘌呤-9-β-D-呋喃核糖苷	2',3',5'-O-triacetyl-6-chloroinosine	5987-73-5	C16H17ClN4O7	412.787
  2’,3’,5’-三乙酰肌苷	2',3',5'-tri-O-acetylinosine	3181-38-2	C16H18N4O8	394.341
  ——	6-chloro-9-(2',3',5'-tri-O-benzoyl-β-D-ribofuranosyl)purine	3510-73-4	C31H23ClN4O7	598.999
• 下游产品

  中文名称	英文名称	CAS号	化学式	分子量
  ——	IST5-002	13484-66-7	C17H20N5O7P	437.349
  ——	(2R,3S,4R,5R)-2-(aminomethyl)-5-[6-(benzylamino)purin-9-yl]oxolane-3,4-diol	211499-27-3	C17H20N6O3	356.384
  ——	N6-benzyl-5'-chloro-5'-deoxyadenosine	111109-98-9	C17H18ClN5O3	375.815
  ——	N6-benzyl-5'-deoxy-5'-(ethylthio)adenosine	——	C19H23N5O3S	401.489
  ——	N6-benzyl-5'-deoxy-5'-(n-propylthio)adenosine	——	C20H25N5O3S	415.516
  ——	N6-benzyl-5'-deoxy-5'-(isopropylthio)adenosine	——	C20H25N5O3S	415.516
  ——	N6-benzylpurine riboside-5'-O-[(phosphonomethyl)phosphonic acid]	——	C18H23N5O9P2	515.356
  ——	8-amino-6-benzylamino-9-(β-D-ribofuranosyl)purine	1427459-34-4	C17H20N6O4	372.384
  ——	N6-benzyl-S-adenosylhomocysteine	111109-99-0	C21H26N6O5S	474.541
  N6-苄基-2',3'-异亚丙基腺苷	((3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-(benzylamino)-9H-purin-9-yl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)methanol	78188-38-2	C20H23N5O4	397.434

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-苄基腺苷 在 ammonium peroxydisulfate 、 phosphate buffer 作用下， 反应 2.0h， 以89%的产率得到腺苷
  参考文献：
  名称：

  A Newly Devised Method for the Debenzylation ofN⁶-Benzyladenosines. A Convenient Synthesis of [6-¹⁵N]-Labeled Adenosines

  摘要：

  [6-N-15]-Labeled adenosine was conveniently prepared from inosine (1a) by the silylation-benzylamination of 1a and subsequent oxidative debenzylation with ammonium peroxydisulfate in a pH 7.2 buffer solution.

  DOI：

  10.1080/15257779408012148
• 作为产物：
  描述：

  6-N-2',3',5'-tri-O-tetraacetyladenosine 在 甲醇 、 氨 、 potassium carbonate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 68.0h， 生成 6-苄基腺苷
  参考文献：
  名称：

  N6-乙酰基-2'，3'，5'-三-O-乙酰腺苷；区域选择性N6-烷基化的便捷“缺失”底物

  摘要：

  在咪唑存在下，在室温下用甲醇对五乙酰基腺苷2进行选择性的N-脱乙酰基化反应，建立了一种简单有效的N 6-乙酰基2'，3'，5'- tri - O-乙酰腺苷（1）路线。 。利用2和1的粗混合物，通过腺苷与乙酸酐在吡啶中在升高的温度下反应制备的混合物，详细说明了1的制备合成。从腺苷开始，总产率为1，为80-85％。结果表明1是选择性N 6的便捷底物-烷基化。该研究揭示了在1与活化的烷基卤化物的碱促进反应和1与醇的光延反应中相同的区域选择性。制备了一系列的N 6-烷基腺苷5a - f。通过使用核苷磷酸化酶和碱性磷酸酶的组合对母体核苷衍生物5b，d，e进行酶促转化来制备细胞分裂素6b，d，e。 细胞分裂素-腺苷衍生物-N 6-烷基化-区域选择性-Mitsunobu反应-核苷磷酸化酶

  DOI：

  10.1055/s-0030-1260090

文献信息

• Regioselective (phenylcarbamoyl)ation of polyhydroxy compounds by phenyl isocyanate-zinc naphthenate
  作者：Shigeyoshi Nishino、Yoshiharu Ishido

  DOI：10.1016/s0008-6215(00)90142-3

  日期：1986.11

  In the presence of zinc naphthenate as the catalyst, the reaction of phenyl isocyanate with 1,2-propanediol and 3,4-O-isopropylidene-d-mannitol gave the primary phenylcarbamates in high yield. 1,2,6-Hexanetriol was selectively phenylcarbamoylated at O-1, and N6-benzyladenosine at O-2′. The common methyl aldohexo- and aldopento-pyranosides gave the 3-mono(phenylcarbamate)s in fair to excellent yields

  在环烷酸锌存在下，苯基异氰酸酯与1,2-丙二醇和3,4-O-异亚丙基-d-甘露糖醇的反应以高收率得到伯苯基氨基甲酸酯。1,2,6-己三醇在O-1处被选择性苯氨基甲酰化，在O-2'处被N6-苄基腺苷选择性地苯甲酰化。常见的甲基乙二醛和醛糖基-吡喃二糖苷以相当高的产率获得了3-单（苯基氨基甲酸酯），在某些情况下还具有相当比例的2-酯。当不使用锌盐时，O-6是六吡喃糖苷中最活泼的氧原子。
• [EN] C-NUCLEOSIDES, C-NUCLEOTIDES AND THEIR ANALOGS, EQUIVALENTS AND PRODRUGS THEREOF FOR ECTONUCLEOTIDASE INHIBITION<br/>[FR] C-NUCLÉOSIDES, C-NUCLÉOTIDES ET LEURS ANALOGUES, ÉQUIVALENTS ET PROMÉDICAMENTS DE CEUX-CI POUR L'INHIBITION DE L'ECTONUCLÉOTIDASE
  申请人：KAINOS MEDICINE INC

  公开号：WO2021040356A1

  公开（公告）日：2021-03-04

  The invention provides novel heterocyclic C-nucleosides, C-nucleotides and their analogues, equivalents, and prodrug thereof. The compounds, compositions, and methods provided of the invention, by themselves or in combination with other therapies are useful for the treatment of a disease, disorder or condition related to CD73 (ecto-5'-nucleotidase) enzyme.

  这项发明提供了新颖的杂环C-核苷、C-核苷酸及其类似物、等效物和前药。该发明提供的化合物、组合物和方法本身或与其他疗法结合使用，可用于治疗与CD73（外切5'-核苷酸酶）酶相关的疾病、紊乱或状况。
• Synthesis and Structure–Activity Relationship Investigation of Adenosine-Containing Inhibitors of Histone Methyltransferase DOT1L
  作者：Justin L. Anglin、Lisheng Deng、Yuan Yao、Guobin Cai、Zhen Liu、Hong Jiang、Gang Cheng、Pinhong Chen、Shuo Dong、Yongcheng Song

  DOI：10.1021/jm300917h

  日期：2012.9.27

  Histone3-lysine79 (H3K79) methyltransferase DOT1L has been found to be a drug target for acute leukemia with MLL (mixed lineage leukemia) gene translocations. A total of 55 adenosine-containing compounds were designed and synthesized, among which several potent DOT1L inhibitors were identified with Ki values as low as 0.5 nM. These compounds also show high selectivity (>4500-fold) over three other histone methyltransferases

  组蛋白 3-赖氨酸 79 (H3K79) 甲基转移酶 DOT1L 已被发现是具有 MLL（混合谱系白血病）基因易位的急性白血病的药物靶点。总共设计和合成了 55 种含腺苷的化合物，其中鉴定了几种有效的 DOT1L 抑制剂，K i值低至 0.5 nM。与其他三种组蛋白甲基转移酶相比，这些化合物还显示出高选择性（> 4500 倍）。讨论了这些化合物对 DOT1L 的抑制活性的构效关系 (SAR)。强效 DOT1L 抑制剂对 MLL 易位白血病细胞系 MV4;11 和 THP1 的增殖具有选择性活性，EC 504–11 μM 的值。等温滴定量热研究表明，两种代表性抑制剂以高亲和力与 DOT1L:核小体复合物结合，仅与酶辅因子 SAM（S-腺苷-1-甲硫氨酸）竞争，而不与底物核小体竞争。
• Selective Inhibitors of Histone Methyltransferase DOT1L: Design, Synthesis, and Crystallographic Studies
  作者：Yuan Yao、Pinhong Chen、Jiasheng Diao、Gang Cheng、Lisheng Deng、Justin L. Anglin、B. V. Venkataram Prasad、Yongcheng Song

  DOI：10.1021/ja206312b

  日期：2011.10.26

  Histone H3-lysine79 (H3K79) methyltransferase DOT1L plays critical roles in normal cell differentiation as well as initiation of acute leukemia. We used structure- and mechanism-based design to discover several potent inhibitors of DOT1L with IC(50) values as low as 38 nM. These inhibitors exhibit only weak or no activities against four other representative histone lysine and arginine methyltransferases

  组蛋白 H3-赖氨酸 79 (H3K79) 甲基转移酶 DOT1L 在正常细胞分化以及急性白血病的发生中起关键作用。我们使用基于结构和机制的设计来发现几种有效的 DOT1L 抑制剂，IC(50) 值低至 38 nM。这些抑制剂对其他四种代表性组蛋白赖氨酸和精氨酸甲基转移酶 G9a、SUV39H1、PRMT1 和 CARM1 仅表现出微弱的活性或没有活性。DOT1L-抑制剂复合物的 X 射线晶体结构表明，抑制剂的 N6-甲基基团有利地位于 DOT1L 的主要疏水腔中，提供了观察到的高选择性。结构分析表明，它将破坏至少一个 H 键和/或对其他组蛋白甲基转移酶具有空间排斥。
• Bis(tributyltin) oxide-phenyl isocyanate system for regioselective (phenylcarbamoyl)ation of purine and pyrimidine ribonucleosides
  作者：Ichiro Hirao、Kiyotaka Itoh、Nobuo Sakairi、Younosuke Araki、Yoshiharu Ishido

  DOI：10.1016/0008-6215(82)84038-x

  日期：1982.11

  Abstract On benzylaminolysis, 5′- O -benzoyl- N 6 -benzyladenosine 2′,3′-carbonate gave a 3:1 mixture of the corresponding 3′- and 2′-benzylcarbamate (67% total yield); hydrazinolysis and hydroxaminolysis were, however, unsuccessful. An alternative approach to regioselective carbamoylation of ribonucleosides, by use of bis(tributyltin) oxide-phenyl isocyanate, was examined, because it is a much simpler

  摘要在苄基氨基分解反应中，由5'-O-苯甲酰基-N 6-苄基腺苷2'，3'-碳酸酯生成3：1的相应3'-和2'-苄基氨基甲酸酯混合物（总收率67％）；但是，肼解和羟氨解均未成功。通过使用双（三丁基锡）氧化物-苯基异氰酸酯，研究了核糖核苷的区域选择性氨基甲酰基化的另一种方法，因为这是一个非常简单的程序。方法A，涉及核糖核苷的两阶段处理，首先在回流下用甲苯中的双（三丁基锡）氧化物在回流下，然后用异氰酸苯酯处理，得到相应的5'-苯基氨基甲酸酯，但仅对N 6可行。 -苄基腺苷。程序B，涉及在溶剂中用双（三丁基锡）氧化物-苯基异氰酸酯一步一步处理核糖核苷，据发现，在适当改变所用溶剂体系的极性（或组成）的情况下，可以选择性地给出相应的3'-或2'-苯基氨基甲酸酯，并且可用于多种核糖核苷。程序B中的2'-脱氧核糖核苷反应引起了人们的关注，因为它可以区域特异性地产生相应的5'-苯基氨基甲酸酯。讨论了可能与这些反应的区域选择性有关的因素。

表征谱图