deoxybouvadin | 64725-24-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: deoxybouvadin
• 英文别名: deoxybouvardin；RA-V；(1S,4R,7S,10S,13S,16S)-24-Hydroxy-10-[(4-methoxyphenyl)methyl]-4,7,9,13,15,29-hexamethyl-22-oxa-3,6,9,12,15,29-hexazatetracyclo[14.12.2.218,21.123,27]tritriaconta-18,20,23,25,27(31),32-hexaene-2,5,8,11,14,30-hexone
• CAS: 64725-24-2
• 化学式: C₄₀H₄₈N₆O₉
• 分子量: 756.856
• InChiKey: VXVGFMUNENQGFW-LZQLRFBTSA-N

物化性质

• 沸点：
  1083.3±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.189±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3
• 重原子数：
  55
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  187
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  deoxybouvadin 在 sodium acetate 、 pyridinium hydrobromide perbromide 作用下， 以 氯仿 、 溶剂黄146 为溶剂， 反应 0.33h， 以93%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  RA-二聚体A，一种来自Rubia cordifolia L的新型二聚体抗肿瘤双环六肽。

  摘要：

  一种新型的抗肿瘤双环六肽二聚体，RA-二聚体A（3），从茜草（Rubia cordifolia L ）的根中分离得到。3的结构通过光谱数据分析和化学相关性确定。肽3是具有二聚体结构的RA同源物的第一个例子。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)01029-7
• 作为产物：
  描述：

  3-乙酰基-N-苄氧羰基-L-酪氨酸甲酯 在 palladium on activated charcoal 2,3,5-三甲基吡啶 、 盐酸 、 lithium hydroxide 、 二苯基磷酸 、 氢气 、 三溴化硼 、 sodium hydride 、 碳酸氢钠 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 间氯过氧苯甲酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， -78.0~130.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 163.0h， 生成 deoxybouvadin
  参考文献：
  名称：

  deoxybouvardin 和 RA-VII 的全合成：通过分子内 Ullmann 反应进行大环化

  摘要：

  我们详细介绍了实施分子内 Ullmann 缩合反应以直接封闭 14 元二芳基醚的成功研究，这些二芳基醚已证明无法通过替代途径或难以通过替代途径获得，以及在 RA-VII 的全合成中使用这种关键的大环化反应和脱氧布瓦丁

  DOI：

  10.1021/ja00004a062

文献信息

• Studies on antitumor cyclic hexapeptides RA obtained from Rubiae Radix, Rubiaceae. III. On derivatives of RA-V and their in vivo activities.
  作者：HIDEJI ITOKAWA、KOICHI TAKEYA、NOBORU MORI、TORU SONOBE、NOBUAKI SERISAWA、TOSHINORI HAMANAKA、SUSUMU MIHASHI

  DOI：10.1248/cpb.32.3216

  日期：——

  With the aim of obtaining compounds with strong antitumor activity and weak toxicity, we have synthesized a series of alkylethers, fatty acid esters, benzoates and other derivatives of RA-V, an antitumor cyclic hexapeptide discovered in Rubiae Radix, and examined their antitumor activities against P-388 lymphocytic leukemia. It was found that the introduction of C1 and C6 chains (hydrophobic coefficient log P=about 3.2 and 5.8, respectively) on the phenol moiety of RA-V gave the most desirable compounds in terms of antitumor activity and toxicity. The caproic ester of RA-V, the n-hexylether of RA-V and RA-VII (C1) also exhibited strong antitumor activity against other experimental tumors (L-1210 lymphocytic leukemia, B-16 melanoma and MM2 mammary carcinoma).

  为了获得具有强抗癌活性和低毒性的化合物，我们合成了一系列由茜草根中发现的一种抗癌环己肽RA-V衍生的烷基醚、脂肪酸酯、苯甲酸酯等，并检验了它们对P-388淋巴细胞白血病的抗癌活性。发现将C1和C6链（疏水系数log P分别约为3.2和5.8）引入RA-V的酚部分所得到的化合物在抗癌活性和毒性方面最为理想。RA-V己酸酯、RA-V正己基醚和RA-VII（C1）也显示出对其他实验性肿瘤（L-1210淋巴细胞白血病、B-16黑色素瘤和MM2乳腺癌）的强抗癌活性。
• Regioselective Synthesis of 14-Membered Biaryl Ethers: Total Synthesis of RA-VII and Deoxybouvardin.
  作者：Tsutomu INOUE、Takashi INABA、Isao UMEZAWA、Masayuki YUASA、Hideji ITOKAWA、Katsuyuki OGURA、Katsuichiro KOMATSU、Hiroshi HARA、Osamu HOSHINO

  DOI：10.1248/cpb.43.1325

  日期：——

  In order to obtain a key compound (22a") for synthesis of RA-VII (1) and deoxybouvardin (2), construction of the 14-membered ring system was performed by means of thallium trinitrate-mediated oxidation of the tetrahalogeno amides 5-7. The dibromo dichloro amide 6 or the bromo trichloro amide 7 gave a natural type of 14-membered ring dienone (23a or 23c), whereas the tetrabromo amide 5 gave an unnatural type of product, 19a. The formation of the latter product 19a could be understood on the basis of energy calculations on plausible intermediates 26a-c and 27a-c in the transition state in the oxidaive coupling reaction. Compound 23a was further converted to 22a" through conventional procedures (aromatization; methylation; catalytic hydrogenation). This intermediate was readily converted to 1 and 2. Thus, total synthesis of RA-VII (1) and deoxybouvardin (2) was achieved for the first time.

  为了获得合成RA-VII（1）和去氧布瓦丁（2）的关键化合物（22a"），通过三硝酸铋介导的氧化反应对四卤酰胺5-7构建了14元环体系。二溴二氯酰胺6或溴三氯酰胺7产生了一种天然类型的14元环二烯酮（23a或23c），而四溴酰胺5则产生了一种非自然的产物19a。产物19a的形成可以通过对氧化偶联反应中可能的过渡态中间体26a-c和27a-c进行能量计算来理解。化合物23a通过常规程序（芳构化；甲基化；催化氢化）进一步转化为22a"。该中间体可以很方便地转化为1和2。因此，RA-VII（1）和去氧布瓦丁（2）的总合成首次得以实现。
• Total synthesis of cycloisodityrosine, RA-VII, deoxybouvardin, and N29-desmethyl-RA-VII: Identification of the pharmacophore and reversal of the subunit functional roles
  作者：Dale L. Boger、Daniel Yohannes、Jiacheng Zhou、Michael A. Patane

  DOI：10.1021/ja00062a004

  日期：1993.5

  Full details of a concise total synthesis of RA-VII (1) and deoxybouvardin (2) are described based on the implementation of an effective intramolecular Ullmann reaction as the key macrocyclization reaction in the preparation of the elusive 14-membered cycloisodityrosine subunit (33) of the bicyclic hexapeptides. Subsequent coupling of 34 to tetrapeptide 17 and macrocyclization with C 2 -N 3 amide bond

  基于有效的分子内 Ullmann 反应作为制备难以捉摸的 14 元环异二酪氨酸亚基 (33) 的关键大环化反应的实施，描述了 RA-VII (1) 和脱氧布瓦丁 (2) 的简明全合成的全部细节的双环六肽。随后 34 与四肽 17 偶联以及大环化与 C 2 -N 3 酰胺键形成提供了 1 和 2。在解决有助于其抗肿瘤活性的药物的关键结构和构象特征的努力中，N 29 -去甲基-RA-制备了 VII 并详细说明了其化学、构象和初步生物学特性
• Studies on Rubia akane(RA) derivatives. Part 8. Design, syntheses and antitumour activity of cyclic hexapeptide RA analogues possessing an alkyl substituent on the Tyr-3 aromatic ring
  作者：Yukio Hitotsuyanagi、Suguru Lee、Izumi Ito、Kazuyuki Kondo、Koichi Takeya、Takehiro Yamagishi、Takatoshi Nagate、Hideji Itokawa

  DOI：10.1039/p19960000213

  日期：——

  The effective conversion of RA-VII 1 into the naturally less-accessible RA-II 4 has been devised through boron tribromide bis-O-demethylation and successive selective partial O-methylation using diazo(trimethylsilyl)methane. The O-triflate 11 prepared from RA-II 4 was subjected to cross-coupling reaction with alkylstannanes to produce analogues 12, 13 and 15, while compounds 13 and 15 were later converted into analogues 14 and 16, respectively. Analogues 12–16 showed antitumour activity against P-388 leukaemia both in vitro and in vivo.

  通过三溴化硼二-O-脱甲基化反应，以及使用重氮（三甲基硅基）甲烷连续选择性地部分 O-甲基化反应，我们设计出了将 RA-VII 1 有效转化为天然难溶性 RA-II 4 的方法。由 RA-II 4 制备的 O-三苯甲酸酯 11 与烷基锡发生交叉耦合反应，生成类似物 12、13 和 15，而化合物 13 和 15 随后又分别转化为类似物 14 和 16。类似物 12-16 对 P-388 白血病具有体外和体内抗肿瘤活性。
• RA-dimer B, a New Dimeric RA-series Cyclopeptide Incorporating Two Different Types of Cycloisodityrosine Units, from<i>Rubia cordifolia</i> L.
  作者：Yukio Hitotsuyanagi、Takayuki Tsuchiya、Masako Ohata、Ayaka Yoshida、Haruhiko Fukaya、Hyun Sun Park、Koichi Takeya、Nobuo Kawahara

  DOI：10.1002/asia.201601138

  日期：2016.12.6

  RA‐dimer B, a new cytotoxic RA‐series peptide, was isolated from the roots of Rubia cordifolia L. Its structure was elucidated on the basis of spectroscopic analysis to be a dimeric cyclopeptide composed of deoxybouvardin and allo‐RA‐V. Those two cyclopeptide units are connected by an ether linkage between the phenolic oxygen atom of deoxybouvardin and the ϵa carbon atom of Tyr‐6 of allo‐RA‐V. RA‐dimer B

  RA-二聚体B是一种新的具有细胞毒性的RA系列肽，是从茜草（Rubia cordifolia  L）的根中分离出来的。在光谱分析的基础上，阐明了其结构是由脱氧布瓦丁和allo-RA-V组成的二聚环肽。这两个环肽单元通过醚键连接在脱氧布瓦丁的酚氧原子与allo-RA-V的Tyr-6的ϵa碳原子之间。RA-二聚体B是通过脱氧布瓦丁与allo-RA-V的硼酸衍生物偶联反应并随后脱保护而合成的，从而证实了其相对立体化学并确定了该肽的绝对构型。RA二聚体B对具有IC的人早幼粒细胞白血病HL-60，人结肠癌HCT-116和人肾细胞癌ACHN细胞显示出细胞毒活性50个0.59，0.54，和0.74μ值米分别。