拉奇霉素 | 69866-21-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 中文名称: 拉奇霉素
• 英文名称: CC-1065
• 英文别名: 5-hydroxy-2-[5-hydroxy-4-methoxy-2-[(1R,12S)-3-methyl-7-oxo-5,10-diazatetracyclo[7.4.0.01,12.02,6]trideca-2(6),3,8-triene-10-carbonyl]-7,8-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-6-carbonyl]-4-methoxy-7,8-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-6-carboximidic acid
• CAS: 69866-21-3
• 化学式: C₃₇H₃₃N₇O₈
• 分子量: 703.711
• InChiKey: UOWVMDUEMSNCAV-WYENRQIDSA-N

物化性质

• 沸点：
  704.36°C (rough estimate)
• 密度：
  1.2929 (rough estimate)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.4
• 重原子数：
  52
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  10.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  210
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  8

制备方法与用途

生物活性

Rachelmycin（CC-1065；NSC 298223）是一种从 Streptomyces zelensis 中分离得到的有效天然抗生素。它在 B 型 DNA 的小沟中以非共价和共价方式结合，并形成 N-3 腺嘌呤加合物。Rachelmycin 具有极强的抗肿瘤活性。

体内研究

最低致延迟死亡剂量实验显示，对于非肿瘤 BDF1 鼠而言，在给药 12.5 mg/kg（CC-1065；NSC 298223）后可观察到延迟死亡现象。

类别

有毒物品

毒性分级

剧毒

急性毒性

• 腹腔注射-小鼠 LD50: 0.0069 毫克/公斤
• 静脉注射-小鼠 LD50: 0.009 毫克/公斤

可燃性危险特性

可燃；燃烧会产生有毒氮氧化物烟雾

储运特性

库房应通风、低温干燥，并与食品原料分开存放

灭火剂

干粉、泡沫、沙土、二氧化碳、雾状水

上下游信息

• 上游原料

  中文名称	英文名称	CAS号	化学式	分子量
  ——	2-[2-[8-(chloromethyl)-4-hydroxy-1-methyl-7,8-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-6-carbonyl]-5-hydroxy-4-methoxy-7,8-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-6-carbonyl]-5-hydroxy-4-methoxy-7,8-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-6-carboxamide	115073-70-6	C37H34ClN7O8	740.172
  ——	6-(6-Carbamoyl-5-hydroxy-4-methoxy-3,6,7,8-tetrahydro-pyrrolo[3,2-e]indole-2-carbonyl)-5-hydroxy-4-methoxy-3,6,7,8-tetrahydro-pyrrolo[3,2-e]indole-2-carboxylic acid	98296-23-2	C25H23N5O8	521.486
  ——	6-benzoyl-5-(benzyloxy)-1,2-dihydro-1-(hydroxymethyl)-8-methyl-3-(phenylsulfonyl)-3H-pyrrolo<3,2-e>indole	112764-66-6	C32H28N2O5S	552.651
  ——	6-benzoyl-5-(benzyloxy)-1,2-dihydro-8-methyl-1-methylidene-3-(phenylsulfonyl)-3H-pyrrolo<3,2-e>indole	112793-55-2	C32H26N2O4S	534.635
  ——	1-benzoyl-7-(benzyloxy)-4-bromo-3-methyl-N5-(phenylsulfonyl)-5-(2-propyn-1-ylamino)indole	112764-65-5	C32H25BrN2O4S	613.532
  ——	5-(benzyloxy)-1,2-dihydro-1-(hydroxymethyl)-8-methyl-3-(phenylsulfonyl)-3H-pyrrolo<3,2-e>indole	112764-67-7	C25H24N2O4S	448.543
  ——	cyclopropapyrroindole	110352-05-1	C12H12N2O	200.24
  ——	(+/-)-(1R*)-5-(benzyloxy)-3-<(tert-butyloxy)carbonyl>-1-(chloromethyl)-8-methyl-1,2-dihydro-3H-pyrrolo<3,2-e>indole	175614-07-0	C24H27ClN2O3	426.943
  ——	(S)-1,6-dihydro-1-(hydroxymethyl)-8-methyl-5-(phenylmethoxy)-benzo[1,2-b:4,3-b']dipyrrole-3(2H)-carboxylic acid 1,1-dimethylethyl ester	112836-67-6	C24H28N2O4	408.497
  ——	(+/-)-(1R*)-5-(benzyloxy)-3-<(tert-butyloxy)carbonyl>-1-(hydroxymethyl)-8-methyl-1,2-dihydro-3H-pyrrolo<3,2-e>indole	112089-71-1	C24H28N2O4	408.497

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  拉奇霉素 在 水 作用下， 以 aq. phosphate buffer 、 二甲基亚砜 为溶剂， 生成 C₃₇H₃₅N₇O₉
  参考文献：
  名称：

  GyrI-like proteins catalyze cyclopropanoid hydrolysis to confer cellular protection

  摘要：

  GyrI-like蛋白质广泛分布于原核生物和真核生物中，并被认为是小分子结合蛋白质。在这里，我们将这些蛋白质的一个亚家族鉴定为环丙烷环丙基水解酶（CCHs），可以催化强效DNA烷基化剂yatakemycin（YTM）和CC-1065的水解。共结晶和分子动力学模拟分析揭示了这些CCHs共享一个保守的芳香笼以进行水解活性。随后的细胞毒性实验证实，CCHs能够保护细胞免受YTM的伤害。因此，我们的发现表明，进化保守的GyrI-like蛋白质不仅通过结合，而且通过催化，赋予细胞对多种异物的保护作用。

  DOI：

  10.1038/s41467-017-01508-1
• 作为产物：
  描述：

  2-氨基-5-硝基苯酚 在 4-二甲氨基吡啶 、 palladium on activated charcoal 、 偶氮二异丁腈 、 四丁基碘化铵 吡啶 、 lead(IV) acetate 、 盐酸 、 四氯化碳 、 sodium hydroxide 、 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 sodium dithionite 、 dimethyl sulfide borane 、 硫酸 、 双氧水 、 三正丁基氢锡 、 ammonium formate 、 sodium hydride 、 碳酸氢钠 、 potassium carbonate 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 乙酰氯 、 三苯基膦 、 红铝 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 、 甲苯 、 乙腈 、 苯 为溶剂， 反应 178.75h， 生成 拉奇霉素
  参考文献：
  名称：

  (.+-.)-N2-(苯磺酰基)-CPI、(.+-.)-CC-1065、(+)-CC-1065、ent-(-)-CC-1065的全合成，以及精确的, 功能剂 (.+-.)-CPI-CDPI2, (+)-CPI-CDPI2, 和 (-)-CPI-CDPI2 [(.+-.)-(3bR*,4aS*)-, (+) -(3bR,4aS)- 和 (-)-(3bS,4aR)-脱氧-CC-1065]

  摘要：

  CPI 对应一个联合国衍生的 de cyclopropa [c] pyrrolo [3,2-e] indole et CDPI 2 ，对应一个 un衍生 de carbonyl-2,3p 双苯并 [1,2-b:4,3-b']双吡咯

  DOI：

  10.1021/ja00222a043

文献信息

• MINOR GROOVE BINDER PHOSPHORAMIDITES AND METHODS OF USE
  申请人：Vorobiev Alexei

  公开号：US20130030166A1

  公开（公告）日：2013-01-31

  Minor groove binder phosphoramidites having unique structures have been synthesized according to particular methods. These minor groove binder phosphoramidites are useful in the preparation of oligonucleotide conjugates, particularly those for use as probes and primers.

  根据特定方法合成了具有独特结构的小沟结合剂磷酰胺酰胺。这些小沟结合剂磷酰胺酰胺在制备寡核苷酸共轭物中很有用，特别是用作探针和引物的情况。
• Total Synthesis of (+)-CC-1065 Utilizing Ring Expansion Reaction of Benzocyclobutenone Oxime Sulfonate
  作者：Taku Imaizumi、Yumi Yamashita、Yuki Nakazawa、Kentaro Okano、Juri Sakata、Hidetoshi Tokuyama

  DOI：10.1021/acs.orglett.9b01690

  日期：2019.8.16

  An indole synthesis via ring expansion of benzocyclobutenone oxime sulfonate was developed. Utility of the indole synthesis was demonstrated by the total synthesis of (+)-CC-1065. The middle and right segments were constructed by a sequential ring expansion of the symmetrical benzo-bis-cyclobutenone. The left segment was also constructed via ring expansion of the methyl-substituted benzocyclobutenone

  开发了通过苯并环丁烯酮肟磺酸酯的扩环合成吲哚的方法。（+）-CC-1065的总合成证明了吲哚合成的效用。中段和右段由对称的苯并双环丁烯酮的连续扩环构成。左链段也通过甲基取代的苯并环丁烯酮肟磺酸盐的扩环而构建。在这三个链段缩合之后，形成二烯酮环丙烷结构以完成总合成。
• Hybridization-triggered fluorescent detection of nucleic acids
  申请人：Dempcy O. Robert

  公开号：US20070166723A1

  公开（公告）日：2007-07-19

  Compositions and methods for fluorescent detection of nucleic acids are provided. The compositions can be detected by fluorescence when hybridized to a nucleic acid containing a target sequence, but are non-fluorescent in the non-hybridized state. Alternatively, the fluorescence properties of the compositions change in a detectable manner upon hybridization to a nucleic acid containing a target sequence. Methods for synthesis and methods of use of the compositions are also provided.

  提供了用于核酸荧光检测的组合物和方法。当与含有目标序列的核酸杂交时，这些组合物可以通过荧光检测，但在未杂交状态下是非荧光的。或者，这些组合物的荧光性能在与含有目标序列的核酸杂交时以可检测的方式发生变化。还提供了合成方法和使用这些组合物的方法。
• COMPOUNDS FOR THE TREATMENT OF COVID-19
  申请人：Dompe' Farmaceutici S.P.A.

  公开号：EP3875078A1

  公开（公告）日：2021-09-08

  The present invention relates to compounds that are able to inhibt 3CL protease of COVID-19 virus, SARS-Cov-2

  本发明涉及能够抑制 COVID-19 病毒、SARS-Cov-2 病毒的 3CL 蛋白酶的化合物。
• Novel Syntheses of Optically Active CC-1065, U-73,975(Adozelesin), U-80,244(Carzelesin), U-77,779 (Bizelesin), KW-2189, and DU-86
  作者：Yasumichi Fukuda、Hirosuke Furuta、Futoshi Shiga、Yoshikazu Asahina、Shiro Terashima

  DOI：10.3987/com-97-7920

  日期：——

  The title syntheses were achieved by the method featuring oxidative cyclization of the enamino esters [(S)-13 and (S)-24] derived from the 5-aminoindoline [(S)-12], acylation with various structural types of indole-2-carboxylic acids, and formation of cyclopropapyrroloindole moieties.