2',3'-O,O-bis(t-butyldimethylsilyl)adenosine | 69504-15-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 2',3'-O,O-bis(t-butyldimethylsilyl)adenosine
• 英文别名: 2',3'-O-bis(tert-butyldimethylsilyl)adenosine；[(2R,3R,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]oxolan-2-yl]methanol
• CAS: 69504-15-0
• 化学式: C₂₂H₄₁N₅O₄Si₂
• 分子量: 495.77
• InChiKey: GAMKBDYUNFPWRM-WVSUBDOOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.08
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.77
• 拓扑面积：
  118
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2',3'-O,O-bis(t-butyldimethylsilyl)adenosine 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 15.0h， 生成 2',3'-bis-O-tert-butyldimethylsilyl-N6-ethoxycarbonyl-5'-O-(N-methylcarbamoyl)adenosine
  参考文献：
  名称：

  合成，SAR，和新颖的抗增殖机理初步评价Ñ 6，5'-双-脲基和5'-氨基甲酰基- ñ 6个-ureidoadenosine衍生物

  摘要：

  我们已经开发了制备有效的方法Ñ 6，5'-双- ureidoadenosine衍生物和它们的5'-氨基甲酰基- ñ 6 -脲基同源。的治疗5'-叠氮基-5'-脱氧Ñ 6 - （ñ -烷基或-arylurea）腺苷衍生物（6A - d）用H 2 /钯-碳或PH 3次/时2 O，随后Ñ -甲基p -nitrophenylcarbamate给ñ 6，5'-双-脲基产品7A - d在49-78％的产率。5'-氨基甲酰基-N 6中的类似衍生物-ureido系列的制备方法是，先用N-甲基-对-硝基苯基氨基甲酸酯处理2'，3'- bis- O -TBS-腺苷（11），然后用适当的异氰酸酯酰化，得到13a - d，产率为45-69％。通过用氯甲酸乙酯处理5' - N-甲基脲基或5'- N-甲基氨基甲酰腺苷衍生物，在55中得到N 6-乙氧羰基衍生物（9和14），从而获得了一种更通用的途径来从这两个系列中获取

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2011.11.043
• 作为产物：
  描述：

  腺苷 在 咪唑 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 78.0h， 生成 2',3'-O,O-bis(t-butyldimethylsilyl)adenosine
  参考文献：
  名称：

  亲脂性核苷类似物作为氨酰基-tRNA合成抑制剂的合成和生物学评估。

  摘要：

  病原菌中新出现的抗生素抗药性和现有抗生素发现管道中化合物的减少是医疗保健专业人员最为关注的问题。潜在的解决方案旨在探索新的或现有的目标/化合物。抑制细菌氨酰基-tRNA合成酶（aaRSs）可能是开发抗生素的目标之一。aaRSs是一组酶，可催化氨基酸转移至同源tRNA，因此在翻译中起关键作用。因此，对这些酶的选择性抑制可能对微生物有害。5'-O-（N-（L-氨基酰基））磺​​酰胺基腺苷（aaSAs）是相应aaRS的有效抑制剂，但是由于它们的极性和带电性质，它们无法穿过细菌膜。在这项工作中 我们增加了这些现有aaSA的亲脂性，以促进它们通过细菌膜的渗透。遵循两种策略，要么通过N6-位的烷基化在腺嘌呤环上连接一个（永久性）烷基部分，要么在α-末端胺基上引入一个亲脂性可生物降解的前药部分，总共有八个新的aaSA类似物。使用纯化的大肠杆菌aaRS酶或在从大肠杆菌获得的总细胞提取物中，对所有合成的化合

  DOI：

  10.3390/antibiotics8040180

文献信息

• Monitoring Poly(ADP-ribosyl)glycohydrolase Activity with a Continuous Fluorescent Substrate
  作者：Bryon S. Drown、Tomohiro Shirai、Johannes Gregor Matthias Rack、Ivan Ahel、Paul J. Hergenrother

  DOI：10.1016/j.chembiol.2018.09.008

  日期：2018.12

  monomers from their protein targets. Existing methods for monitoring these hydrolases rely on detection of the natural substrate, PAR, commonly achieved via radioisotopic labeling. Here we disclose a general substrate for monitoring PARG activity, TFMU-ADPr, which directly reports on total PAR hydrolase activity via release of a fluorophore; this substrate has excellent reactivity, generality (processed by

  翻译后修饰（PTM）和信号分子聚（ADP-核糖）（PAR）对多种生物过程都有影响。此PTM受一系列ADP-核糖基糖水解酶（PARG酶）调控，该酶可将聚合物裂解和/或将单体从其蛋白质靶标中释放出来。监测这些水解酶的现有方法依赖于通常通过放射性同位素标记实现的天然底物PAR的检测。在这里，我们公开了用于监测PARG活性的通用底物TFMU-ADPr，其通过荧光团的释放直接报告总PAR水解酶活性。这种底物具有出色的反应性，通用性（由主要的PARG酶处理），稳定性和可用性。第二种底物TFMU-IDPr仅从酶ARH3选择性报告PARG活性。在全细胞裂解物实验中使用这些探针揭示了霍乱毒素可抑制ARH3的机制。TFMU-ADPr和TFMU-IDPr是用于评估体外小分子抑制剂和探索ADP-核糖基分解代谢酶调控的多功能工具。
• [EN] FLUORESCENT SUBSTRATES FOR POLY(ADP-RIBOSYL) HYDROLASES<br/>[FR] SUBSTRATS FLUORESCENTS POUR POLY(ADP-RIBOSYL) HYDROLASES
  申请人：UNIV ILLINOIS

  公开号：WO2020055753A1

  公开（公告）日：2020-03-19

  The post-translational modification (PTM) and signaling molecule poly(ADP-ribose) (PAR) has an impact on diverse biological processes. PTM is regulated by a series of ADP-ribosyl glycohydrolases (PARG enzymes) that cleave polymers and/or liberate monomers from their protein targets. Disclosed herein is a substrate for monitoring PARG activity, TFMU-ADPr, which directly reports on total PAR hydrolase activity via release of a fluorophore; this substrate has excellent reactivity, generality, stability, and usability. A second substrate, TFMU-IDPr, selectively reports on PARG activity only from the enzyme ARH3. Use of these probes in whole-cell lysate experiments has revealed a mechanism by which ARH3 is inhibited by cholera toxin. TFMU-ADPr and TFMU-IDPr are versatile tools for assessing small-molecule inhibitors in vitro and probing the regulation of ADP-ribosyl catabolic enzymes.

  翻译结果：翻译后修饰（PTM）和信号分子聚腺苷二磷酸核糖（PAR）对多种生物过程产生影响。PTM受一系列ADP核糖水解酶（PARG酶）调控，这些酶从它们的蛋白靶标中切割聚合物和/或释放单体。本文披露了一种用于监测PARG活性的底物，TFMU-ADPr，它通过释放荧光团直接报告总PAR水解酶活性；该底物具有出色的反应性、普适性、稳定性和可用性。第二种底物TFMU-IDPr，只选择性地报告来自酶ARH3的PARG活性。在全细胞裂解液实验中使用这些探针揭示了一种由霍乱毒素抑制ARH3的机制。TFMU-ADPr和TFMU-IDPr是评估体外小分子抑制剂和探究ADP核糖降解酶调控的多功能工具。
• Base substituted 5′-O-(N-isoleucyl)sulfamoyl nucleoside analogues as potential antibacterial agents
  作者：Bharat Gadakh、Gaston Vondenhoff、Eveline Lescrinier、Jef Rozenski、Mathy Froeyen、Arthur Van Aerschot

  DOI：10.1016/j.bmc.2014.03.040

  日期：2014.5

  and evaluated several isoleucyl-sulfamoyl nucleoside analogues with either uracil, cytosine, hypoxanthine, guanine, 1,3-dideaza-adenine (benzimidazole) or 4-nitro-benzimidazole as the heterocyclic base. Based on the structure and antibacterial activity of microcin C, we also prepared their hexapeptidyl conjugates in an effort to improve their uptake potential. We further compared their antibacterial

  氨基酰基氨磺酰基腺苷是体外相应的原核和真核tRNA合成酶的众所周知的纳摩尔抑制剂。受Cubist Pharmaceuticals含芳基四唑的化合物和天然抗生素albomycin中发现的修饰碱基的启发，氨磺酰化腺苷的选择性问题促使我们研究腺嘌呤碱基在药理上的重要性。因此，我们合成并评估了几种异亮氨酰氨磺酰基核苷类似物，它们具有尿嘧啶，胞嘧啶，次黄嘌呤，鸟嘌呤，1，3-二氮杂腺嘌呤（苯并咪唑）或4-硝基苯并咪唑作为杂环碱基。基于微霉素C的结构和抗菌活性，我们还制备了它们的六肽基缀合物，以提高它们的吸收潜力。我们进一步在体外和细胞分析中将它们的抗菌活性与母体异亮氨酰氨磺酰基腺苷（Ile-SA）进行了比较。令人惊讶地，发现含有尿嘧啶类似物的最强的体外抑制作用16楼。不幸的是，由于低吸收，仅发现非常弱的生长抑制特性。根据先前的文献发现对结果进行讨论。
• Ring-Open Analogues of Adenine Nucleoside. Aminoacyl Derivatives of Cyclo- and Acyclo-Nucleosides
  作者：Gholam H. Hakimelahi、Morteza Zarrinehzad、Ali A. Jarrahpour、Hashem Sharghi

  DOI：10.1002/hlca.19870700127

  日期：1987.2.4

  The synthesis of acyclic analogues of ribo- and deoxyribonucleosides is described. These compounds (Table 3) are both poor substrates and poor inhibitors of adenosine deaminase. The synthesis of dinucleotides from these analogues is also described, and the activity along with the inhibitory properties of some of them are studied against deaminase enzyme. These nucleotides are resistant to degradation

  描述了核糖核苷和脱氧核糖核苷的无环类似物的合成。这些化合物（表3）都是差的底物和差的腺苷脱氨酶抑制剂。还描述了由这些类似物合成二核苷酸，并研究了其中一些的活性及其对脱氨酶的抑制特性。这些核苷酸抗磷酸二酯酶降解。浸渍在硅胶上的HCl是用于制备无环核苷的氯甲基醚前体的极佳试剂。开发了一种通用且快速的程序来制备和分离机器人核糖和阿拉伯核糖核苷的5'-氨基酰基衍生物。喹啉在没有外消旋作用下对氨基酰化有显着影响。化合物35a，b在体外具有显着的抗病毒作用。还开发了将无环核糖核苷13e，f转化为无环脱氧核糖核苷11e，f的方法。
• Ceric Ammonium Nitrate on Silica Gel for Efficient and Selective Removal of Trityl and Silyl Groups
  作者：Jih Ru Hwu、Moti L. Jain、Fu-Yuan Tsai、Shwu-Chen Tsay、Arumugham Balakumar、Gholam H. Hakimelahi

  DOI：10.1021/jo000024o

  日期：2000.8.1

  triisopropylsilyl group from a primary hydroxyl functionality in di- or trisilyl ethers of ribonucleosides. A comparative study of deprotection reactions by utilization of CAN alone or CAN-SiO2 indicates a remarkable increase in the rate of the reactions involving a solid support. The mechanism of electron-transfer processes is proposed for the use of CAN-SiO2 in the removal of these protective groups from organic

  发现硅胶负载的硝酸铈铵（CAN-SiO2）在温和条件下可从受保护的核苷和核苷酸中快速选择性地裂解三苯甲基（Tr），单甲氧基三苯甲基（MMTr）和二甲氧基三苯甲基（DMTr）基团。脱保护的效率取决于所得碳阳离子物质的稳定性：DMTr +> MMTr +> Tr +。使用催化量的这种固体负载的试剂还可以有效地和选择性地从核糖核苷的二或三甲硅烷基醚中的伯羟基官能团中除去叔丁基二甲基甲硅烷基或三异丙基甲硅烷基。通过单独使用CAN或CAN-SiO2进行脱保护反应的比较研究表明，涉及固相支持物的反应速率显着提高。