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表观遗传学(Epigenetics)

表观遗传学的概念源于遗传学,它并非单纯由体外环境引起的甲基化和乙酰化改变,也不仅限于转录因子或miRNA等基因调控机制,而是指由于非DNA序列变异导致的、可遗传的表型变化。当前许多所谓的表观遗传学研究尚未超越经典遗传学的定义。

**表观遗传学(Epigenetics)**是指基于非基因序列改变所引起基因表达水平的变化,包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色体重塑和非编码RNA调控等过程。这些变化主要通过影响基因转录或翻译来调节其功能与特性。此类标志物的应用目标是:①预测药物反应或预后个体差异,筛选适合患者的药物、剂量及给药方式,以指导治疗;②作为分子靶标,通过逆转异常的表观修饰,开辟肿瘤治疗的新途径。

DNA甲基化是指在DNA甲基转移酶的作用下,在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5'碳位形成共价键结合一个甲基基团。通常情况下,人类基因组中的“垃圾”序列CpG二核苷酸相对较少,并且处于高度甲基化状态;相反,富含CpG二核苷酸、大小约为100-1000 bp的CpG岛则保持未甲基化状态,并与约56%的人类基因组编码基因相关。根据人类基因组序列草图分析,人类基因组中CpG岛总数约为28,890个,平均每1 MB含约10.5个CpG岛,其数量与基因密度呈良好对应关系。由于DNA甲基化与人类发育和肿瘤疾病密切相关,尤其是CpG岛的甲基化导致抑癌基因转录失活的问题,因此DNA甲基化成为表观遗传学和表观基因组学的重要研究内容。

此外,异常的“表观遗传”变化认为过敏性疾病的发生是由环境因素与基因相互作用的结果。这些环境因素如感染、食物、被动吸烟及过敏原等可通过调节IFN-γ和IL-4基因位点组蛋白的乙酰化/去乙酰化以及甲基化/去甲基化,影响Tb/Tb细胞的分化,从而引发异常表观遗传现象或称为“表突变”(epimutation)。

中文名称 英文名称 CAS号 化学式 结构式图片
3-[(二甲基氨基)甲基]-n-[2-[4-[(羟基氨基)羰基]苯氧基]乙基]-2-苯并呋喃羧酰胺 abexinostat 783355-60-2 C21H23N3O5
3-[(二甲基氨基)甲基]-n-[2-[4-[(羟基氨基)羰基]苯氧基]乙基]-2-苯并呋喃羧酰胺
2-甲氧基-N-(3-甲基-2-氧代-1,2,3,4-四氢喹唑啉-6-基)苯磺酰胺 PFI-1 1403764-72-6 C16H17N3O4S
2-甲氧基-N-(3-甲基-2-氧代-1,2,3,4-四氢喹唑啉-6-基)苯磺酰胺
2-氰基-3-[5-(2,5-二氯苯基)-2-呋喃基]-N-5-喹啉基-2-丙烯酰胺 2-Propenamide, 2-cyano-3-(5-(2,5-dichlorophenyl)-2-furanyl)-N-5-quinolinyl- 304896-28-4 C23H13Cl2N3O2
2-氰基-3-[5-(2,5-二氯苯基)-2-呋喃基]-N-5-喹啉基-2-丙烯酰胺
2-[2-(4-庚基苯基)乙基]-6-羟基苯甲酸 MG149 1243583-85-8 C22H28O3
2-[2-(4-庚基苯基)乙基]-6-羟基苯甲酸
2-[(2-羟基萘-1-基亚甲基)氨基]-n-(1-苯乙基)苯甲酰胺 sirtinol 410536-97-9 C26H22N2O2
2-[(2-羟基萘-1-基亚甲基)氨基]-n-(1-苯乙基)苯甲酰胺
2-(二苯基氨基)-n-[7-(羟基氨基)-7-氧代庚基]-5-嘧啶羧酰胺 ACY-1215 1316214-52-4 C24H27N5O3
2-(二苯基氨基)-n-[7-(羟基氨基)-7-氧代庚基]-5-嘧啶羧酰胺
2-(4-(2-羟基乙氧基)-3,5-二甲基苯基)-5,7-二甲氧基喹唑啉-4(3H)-酮 RVX-208 1044870-39-4 C20H22N2O5
2-(4-(2-羟基乙氧基)-3,5-二甲基苯基)-5,7-二甲氧基喹唑啉-4(3H)-酮
1,2-二氢-3H-萘并[2,1-b]吡喃-3-酮 splitomicin 5690-03-9 C13H10O2
1,2-二氢-3H-萘并[2,1-b]吡喃-3-酮
1,1'-[2-(苯基氨基)-1,4-亚苯基]二[1-[4-(1-吡咯烷基)-1-哌啶基]甲酮] UNC1215 1415800-43-9 C32H43N5O2
1,1'-[2-(苯基氨基)-1,4-亚苯基]二[1-[4-(1-吡咯烷基)-1-哌啶基]甲酮]
(S)-4-(4-氯苯基)-N-(4-羟基苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩并[3,2-F][1,2,4]三唑并[4,3-A][1,4]二氮杂卓-6-乙酰胺 OTX-015 202590-98-5 C25H22ClN5O2S
(S)-4-(4-氯苯基)-N-(4-羟基苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩并[3,2-F][1,2,4]三唑并[4,3-A][1,4]二氮杂卓-6-乙酰胺
(S)-(+)-N-羟基-4-(3-甲基-2-苯基丁酰氨基)苯甲酰胺 AR-42 935881-37-1 C18H20N2O3
(S)-(+)-N-羟基-4-(3-甲基-2-苯基丁酰氨基)苯甲酰胺
(S)-(+)-2-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩并[3,2-F][1,2,4]三唑并[4,3-A][1,4]二氮杂卓-6-基)乙酸叔丁酯 (S)-tert-butyl 2-(4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl)acetate 1268524-70-4 C23H25ClN4O2S
(S)-(+)-2-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩并[3,2-F][1,2,4]三唑并[4,3-A][1,4]二氮杂卓-6-基)乙酸叔丁酯
(2E)-N-(2-氨基苯基)-3-[1-[[4-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)苯基]磺酰基]-1H-吡咯-3-基]-2-丙烯酰胺 (E)-N-(2-aminophenyl)-3-(1-((4-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)phenyl)sulfonyl)-1H-pyrrol-3-yl)acrylamide 910462-43-0 C23H21N5O3S
(2E)-N-(2-氨基苯基)-3-[1-[[4-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)苯基]磺酰基]-1H-吡咯-3-基]-2-丙烯酰胺
(2E)-3-[2-丁基-1-[2-(二乙基氨基)乙基]-1H-苯并咪唑-5-基]-N-羟基丙烯酰胺 pracinostat 929016-96-6 C20H30N4O2
(2E)-3-[2-丁基-1-[2-(二乙基氨基)乙基]-1H-苯并咪唑-5-基]-N-羟基丙烯酰胺
—— (1S,4S,10S,21R)-7-Ethylidene-4,21-di(propan-2-yl)-2-oxa-12,13-dithia-5,8,20,23-tetrazabicyclo[8.7.6]tricos-16-ene-3,6,9,19,22-pentone 128517-07-7 C24H36N4O6S2
(1S,4S,10S,21R)-7-Ethylidene-4,21-di(propan-2-yl)-2-oxa-12,13-dithia-5,8,20,23-tetrazabicyclo[8.7.6]tricos-16-ene-3,6,9,19,22-pentone
—— C646 328968-36-1 C24H19N3O6
C646
—— tubacin 537049-40-4 C41H43N3O7S
tubacin
—— Pharmakon1600-01300040 1716-12-7 C10H12NaO2+
Pharmakon1600-01300040
—— Cyclo[(2Z)-2-amino-2-butenoyl-L-valyl-(3S,4E)-3-hydroxy-7-mercapto-4-heptenoyl-D-valyl-D-cysteinyl], cyclic (3-->5)-disulfide 128517-07-7 C24H36N4O6S2
Cyclo[(2Z)-2-amino-2-butenoyl-L-valyl-(3S,4E)-3-hydroxy-7-mercapto-4-heptenoyl-D-valyl-D-cysteinyl], cyclic (3-->5)-disulfide
—— 2(1H)-Pyrimidinone, 1-beta-D-ribofuranosyl- 3690-10-6 C9H12N2O5
2(1H)-Pyrimidinone, 1-beta-D-ribofuranosyl-
—— EPZ5676 1380288-87-8 C30H42N8O3
EPZ5676
—— (1S,4S,7Z,10S,21R)-7-ethylidene-4,21-di(propan-2-yl)-2-oxa-12,13-dithia-5,8,20,23-tetrazabicyclo[8.7.6]tricos-16-ene-3,6,9,19,22-pentone 128517-07-7 C24H36N4O6S2
(1S,4S,7Z,10S,21R)-7-ethylidene-4,21-di(propan-2-yl)-2-oxa-12,13-dithia-5,8,20,23-tetrazabicyclo[8.7.6]tricos-16-ene-3,6,9,19,22-pentone
—— 2-cyano-3-[5-(2,5-dichlorophenyl)-2-furanyl]-N-(5-quinolinyl)-2-propenamide 304896-28-4 C23H13Cl2N3O2
2-cyano-3-[5-(2,5-dichlorophenyl)-2-furanyl]-N-(5-quinolinyl)-2-propenamide
—— Ammonaps 1716-12-7 C10H11O2*Na
Ammonaps
—— 4-[(2Z)-2-(2-amino-5-methyl-4-oxocyclohexa-2,5-dien-1-ylidene)hydrazinyl]-N-pyridin-2-ylbenzenesulfonamide 1395084-25-9 C18H17N5O3S
4-[(2Z)-2-(2-amino-5-methyl-4-oxocyclohexa-2,5-dien-1-ylidene)hydrazinyl]-N-pyridin-2-ylbenzenesulfonamide
—— romidepsin 128517-07-7 C24H36N4O6S2
romidepsin
—— GSKJ4 1373423-53-0 C24H27N5O2
GSKJ4
—— 7-Ethylidene-4,21-di(propan-2-yl)-2-oxa-12,13-dithia-5,8,20,23-tetrazabicyclo[8.7.6]tricos-16-ene-3,6,9,19,22-pentone 128517-07-7 C24H36N4O6S2
7-Ethylidene-4,21-di(propan-2-yl)-2-oxa-12,13-dithia-5,8,20,23-tetrazabicyclo[8.7.6]tricos-16-ene-3,6,9,19,22-pentone