Binding pattern of intermediate UDP-4-keto-xylose to human UDP-xylose synthase: Synthesis and STD NMR of model keto-saccharides
作者:Claudia Puchner、Thomas Eixelsberger、Bernd Nidetzky、Lothar Brecker
DOI:10.1016/j.carres.2016.11.001
日期:2017.1
molecular modeling studies of UDP-Xyl-4O. STD NMR results of Me-Xyl-4O are in good agreement with simulations of the intermediate UDP-Xyl-4O indicating a strong interaction of proton H3 with the enzyme, potentially caused by active site residue Ala79. In contrast, pyranoside binding pattern studies of methyl uronic acids showed some differences compared to previously published STD NMR results of UDP-glycosides
人UDP-木糖合酶(hUXS1)通过中间UDP-4-酮木糖(UDP-Xyl-4O)专门将UDP-葡萄糖醛酸转化为UDP-木糖。据报道,合成诸如甲基-4-酮-木糖(Me-Xyl-4O)之类的模型化合物,以研究其与hUXS1的结合模式。因此,所需羟基官能团的选择性氧化需要采用保护基化学。通过氘化磷酸钾缓冲液中存在的形式,通过1H和13C NMR光谱研究了没有酶的合成酮糖的溶液行为。在所有研究的酮糖中均观察到了酮-烯醇互变异构现象,而对于4-酮-木糖衍生物仅观察到了宝石二醇水合物形式。饱和转移差异(STD)NMR用于研究合成的酮-糖苷与野生型hUXS1的结合。产生的表位图与UDP-Xyl-4O的较早发表的分子建模研究相关。Me-Xyl-4O的STD NMR结果与中间UDP-Xyl-4O的模拟非常吻合,表明质子H3与酶的强相互作用,可能是由活性位点残基Ala79引起的。相反,与先前发表的UDP-糖苷的STD