3',5'-di-O-benzoyl-5-fluoro-2'-deoxyuridine | 2691-71-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 3',5'-di-O-benzoyl-5-fluoro-2'-deoxyuridine
• 英文别名: 3',5'-di-bz-5-fluoro-2'-deoxyuridine；3',5'-Di-O-benzoyl-2'-deoxy-5-fluoruridin；3',5'-Di-O-benzoyl-5-fluor-2'deoxyuridin；3',5'-di-O-benzoyl-FUdR；O^3'_,O5'-dibenzoyl-5-fluoro-2'-deoxy-uridine；[(2R,3S,5R)-3-benzoyloxy-5-(5-fluoro-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl benzoate
• CAS: 2691-71-6
• 化学式: C₂₃H₁₉FN₂O₇
• 分子量: 454.411
• InChiKey: QSWJDRDXNLNCJA-IPMKNSEASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.8
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.22
• 拓扑面积：
  111
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3',5'-di-O-benzoyl-5-fluoro-2'-deoxyuridine 在 sodium methylate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 生成 5-氟-2'-脱氧脲核苷
  参考文献：
  名称：

  Preparation, antibacterial effects and enzymatic degradation of 5-fluorouracil nucleosides

  摘要：

  在冰乙酸中，尿嘧啶的苄酰化醛基五糖衍生物与氟反应生成了苄酰化的5-氟尿嘧啶核苷。它们的甲醇解产生了以下的游离5-氟尿嘧啶核苷：β-D-核糖呋喃苷（Id）、2-脱氧-β-D-核糖呋喃苷（IId）、它们的对映异构体VIII和IX、α-D-核糖呋喃苷（XIII）、2-脱氧-α-D-核糖呋喃苷（XV）、β-D-阿拉伯呋喃苷（IV）及其L-对映体X、β-D-木糖呋喃苷（V）及其α-D-异构体XI、α-L-吕糖呋喃苷（VI）和2-脱氧-α-L-吕糖呋喃苷（VII）以及后两种化合物的对映体XII和XIV。类似地获得了5-脱氧-β-D-核糖呋喃苷（III）、β-D-核糖吡喃苷（XVI）和1-(S)-(2,3-二羟基丙基)-5-氟尿嘧啶（XVIIc）。1-丙烯基-5-氟尿嘧啶（XVIII）是通过丙烯基溴和2,4-双(三甲基硅氧基)-5-氟嘧啶反应制备的。大肠杆菌的细胞提取物可裂解所有5-氟尿嘧啶核苷，其中核苷碳原子具有R-构型，糖基的3'-羟基与碱基呈反式关系。不具备这些结构特征的化合物是抗性的。除了在酶解时产生5-氟尿嘧啶的核苷外，还有不可裂解的1-(2-脱氧-β-L-核糖呋喃基)-5-氟尿嘧啶（IX）、1-(2-脱氧-α-D-核糖呋喃苷)-5-氟尿嘧啶（XV）和1-(2-脱氧-α-D-吕糖呋喃苷)-5-氟尿嘧啶（XIV）对大肠杆菌表现出抗菌作用（ID50为1.0-2.5 x 10^-5 M）。这种效应可以被2'-脱氧尿苷而不是胸苷逆转。

  DOI：

  10.1135/cccc19803217
• 作为产物：
  描述：

  1,3,5-三苯甲酰基-D-呋喃核糖 在 2,6-二甲基吡啶 、 magnesium(II) perchlorate 、 N-甲基咔唑 、 四氯化锡 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 、 异丙醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 8.5h， 生成 3',5'-di-O-benzoyl-5-fluoro-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  通过苯甲酰基保护的核糖和阿拉伯糖核苷的光诱导电子转移脱氧的立体控制合成脱氧核糖核苷。

  摘要：

  描述了β2'-脱氧-，α2'-脱氧-，β3'-脱氧-和β2'，3'-脱氧核糖核苷的立体控制的从头合成。合成了具有战略指导意义的受保护的核糖，阿拉伯糖和木糖糖基化前体，它们带有能够指导Vorbrüggen糖基化的C2-酯。关键步骤是所需羟基作为苯甲酰基-或3-（三氟甲基）苯甲酰基衍生物的区域选择性脱氧。该脱氧是通过使用咔唑衍生物作为光敏剂的光诱导电子转移（PET）机制完成的。所需脱氧核苷的合成通常从一个容易获得的常见前体分三步进行。

  DOI：

  10.1021/jo0003652

文献信息

• Regioselective acylation of nucleosides and their analogs catalyzed by Pseudomonas cepacia lipase: enzyme substrate recognition
  作者：Ning Li、Min-Hua Zong、Ding Ma

  DOI：10.1016/j.tet.2008.11.045

  日期：2009.1

  The substrate recognition of Pseudomonas cepacia lipase in the acylation of nucleosides was investigated by means of rational substrate engineering for the first time. P. cepacia lipase displayed excellent 3′-regioselectivities (96 to >99%) in the lauroylation of 2′-deoxynucleosides 1a–1e, while low to good 3′-regioselectivities (59–89%) in the lauroylation of ribonucleosides 1f–1j. It might be due

  首次通过合理的底物工程研究了假单胞菌脂肪酶在核苷酰化中的底物识别。P. cepacia脂肪酶在2'-脱氧核苷1a - 1e的月桂酰化中显示出极好的3'-区域选择性（96至> 99％），而在核糖核苷1f -12的月桂酰化中显示低至良好的3'-区域选择性（59-89％）。1J。这可能是由于1f – 1j的2'-羟基之间不利的氢键相互作用酪氨酸残基中的酪氨酸残基和酚羟基存在于酶的另一个疏水口袋中，可稳定5'-酰化过渡态的构象，从而增加次要区域异构体的数量。此外，脂肪酶成功地合成了氟尿苷的各种酯衍生物，其转化率高（99％），并且在温和条件下具有良好至优异的3'-区域选择性。检查了酶对各种酰基供体的识别。根据脂肪酶活性位点的结构，尤其是大小，形状和理化性质，对酰基的酶促识别是合理的。
• 高纯度5-氟-脱氧尿嘧啶核苷的制备方法
  申请人：上海兆维科技发展有限公司

  公开号：CN103897007B

  公开（公告）日：2017-03-29

  本发明公开了一种高纯度5‑氟‑脱氧尿嘧啶核苷的制备方法。所述方法包括步骤：（A）将如结构式B所示的5‑氟‑脱氧尿嘧啶核苷衍生物和能够脱除羟基保护基的试剂混合，在5‑40℃反应，得到反应体系A；（B）使反应体系A溶解于有机溶剂中，在0‑15℃结晶得到如结构式A所示的5‑氟‑脱氧尿嘧啶核苷；所述脱除羟基保护基的试剂选自氨水及甲醇胺溶液、氢氧化钠及氢氧化钾的水溶液、冰醋酸、三氟醋酸或四丁基氟化铵。
• SYNTHESIS OF 2'-DEOXYRIBONUCLEOSIDES: b-3',5'-DI-O-BENZOYLTHYMIDINE
  作者：Prudhomme, Daniel R.、Park, Minnie、Wang, Zhiwei、Buck, Jason R.、Rizzo, Carmelo J.、Chambournier, Gilles、Djung, Jane、Hart, David J.

  DOI：10.15227/orgsyn.077.0162

  日期：——
• Stereocontrolled de Novo Synthesis of β-2‘-Deoxyribonucleosides
  作者：Minnie Park、Carmelo J. Rizzo

  DOI：10.1021/jo960936j

  日期：1996.1.1
• Preparation, antibacterial effects and enzymatic degradation of 5-fluorouracil nucleosides
  作者：Beatrice Schwarz、Dieter Cech、Antonín Holý、Jan Škoda

  DOI：10.1135/cccc19803217

  日期：——

  Reaction of perbenzoylated aldopentafuranosyl derivatives of uracil with fluorine in acetic acid afforded perbenzoylated 5-fluorouracil nucleosides. Their methanolysis gave the following free nucleosides of 5-fluorouracil: β-D-ribofuranoside (Id), 2-deoxy-β-D-ribofuranoside (IId), their enantiomers VIII and IX, α-D-ribofuranoside (XIII), 2-deoxy-α-D-ribofuranoside (XV), β-D-arabinofuranoside (IV) and its L-enantiomer X, β-D-xylofuranoside (V) and its α-D-anomer XI, α-L-lyxofuranoside (VI) and 2-deoxy-α-L-lyxofuranoside (VII) and the enantiomers of the latter two compounds, XII and XIV, respectively. Analogously were obtained 5-deoxy-β-D-ribofuranoside (III), β-D-ribopyranoside (XVI) and 1-(S)-(2,3-dihydroxypropyl)-5-fluorouracil (XVIIc). 1-Allyl-5-fluorouracil (XVIII) was prepared by reaction of allyl bromide with 2,4-bis(trimethylsilyloxy)-5-fluoropyrimidine. The cell-free extract from Escherichia coli cleaves all the 5-fluorouracil nucleosides in which the nucleoside carbon atom has the R-configuration and the 3'-hydroxyl of the sugar moiety is in trans-relation to the base. Compounds which have not these structural features are resistant. Besides nucleosides which on enzymatic cleavage afford 5-fluorouracil, also the non-cleavable 1-(2-deoxy-β-L-ribofuranosyl)-5-fluorouracil (IX), 1-(2-deoxy-α-D-ribofuranosyl)-5-fluorouracil (XV) and 1-(2-deoxy-α-D-lyxofuranosyl)-5-fluorouracil (XIV) exhibit an antibacterial effect towards E. coli (ID₅₀ 1.0-2.5 . 10^-5 M). This effect can be reversed by 2'-deoxyuridine but not by thymidine.

  在冰乙酸中，尿嘧啶的苄酰化醛基五糖衍生物与氟反应生成了苄酰化的5-氟尿嘧啶核苷。它们的甲醇解产生了以下的游离5-氟尿嘧啶核苷：β-D-核糖呋喃苷（Id）、2-脱氧-β-D-核糖呋喃苷（IId）、它们的对映异构体VIII和IX、α-D-核糖呋喃苷（XIII）、2-脱氧-α-D-核糖呋喃苷（XV）、β-D-阿拉伯呋喃苷（IV）及其L-对映体X、β-D-木糖呋喃苷（V）及其α-D-异构体XI、α-L-吕糖呋喃苷（VI）和2-脱氧-α-L-吕糖呋喃苷（VII）以及后两种化合物的对映体XII和XIV。类似地获得了5-脱氧-β-D-核糖呋喃苷（III）、β-D-核糖吡喃苷（XVI）和1-(S)-(2,3-二羟基丙基)-5-氟尿嘧啶（XVIIc）。1-丙烯基-5-氟尿嘧啶（XVIII）是通过丙烯基溴和2,4-双(三甲基硅氧基)-5-氟嘧啶反应制备的。大肠杆菌的细胞提取物可裂解所有5-氟尿嘧啶核苷，其中核苷碳原子具有R-构型，糖基的3'-羟基与碱基呈反式关系。不具备这些结构特征的化合物是抗性的。除了在酶解时产生5-氟尿嘧啶的核苷外，还有不可裂解的1-(2-脱氧-β-L-核糖呋喃基)-5-氟尿嘧啶（IX）、1-(2-脱氧-α-D-核糖呋喃苷)-5-氟尿嘧啶（XV）和1-(2-脱氧-α-D-吕糖呋喃苷)-5-氟尿嘧啶（XIV）对大肠杆菌表现出抗菌作用（ID50为1.0-2.5 x 10^-5 M）。这种效应可以被2'-脱氧尿苷而不是胸苷逆转。