螺[1-氮杂二环[2.2.1]庚烷-3,5-噁唑烷]-2-酮(9CI) | 23784-20-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 中文名称: 螺[1-氮杂二环[2.2.1]庚烷-3,5-噁唑烷]-2-酮(9CI)
• 英文名称: 2-Butenethioic acid,S-[2-(acetylamino)ethyl] ester
• 英文别名: S-(2-Acetamidoethyl) but-2-enethioate
• CAS: 23784-20-5
• 化学式: C₈H₁₃NO₂S
• 分子量: 187.263
• InChiKey: NPCILKSVBCGAGM-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.8
• 重原子数：
  12
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  71.5
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  螺[1-氮杂二环[2.2.1]庚烷-3,5-噁唑烷]-2-酮(9CI) 、 聚甘氨酸 在 thioesterase SAV₆₀₆ from Streptomyces avermitilis MA-4680 作用下， 反应 20.0h， 生成 (R)-3-((carboxymethyl)amino)butanoic acid
  参考文献：
  名称：

  双功能硫酯酶SAV606的结构分析揭示了甘氨酸向α，β-不饱和硫酯添加迈克尔的机理。

  摘要：

  硫酯酶催化酰基硫酯的水解以释放羧酸或大环化以在脂肪酸，聚酮化合物或非核糖体肽的生物合成中产生相应的大环。最近，我们报道了来自链霉菌属的硫酯酶CmiS1。MJ635-86F5在大内酰胺抗生素克雷米霉素的生物合成中，催化甘氨酸向α，β-不饱和脂肪酰基硫代酯的迈克尔加成反应，然后经硫酯水解。但是，CmiS1催化反应的分子机制尚不清楚。在这里，我们报道了来自阿维链霉菌MA-4680的CmiS1同系物SAV606的功能和结构表征。体外分析表明，SAV606催化甘氨酸向巴豆酸硫酯的迈克尔加成反应，随后水解生成（R）-N-羧甲基-3-氨基丁酸。我们还确定了SAV606的晶体结构，既无配体形式，分辨率为2.4Å，又与（R）-N-羧甲基-3-氨基丁酸，复合物，分辨率为2.0Å。我们发现SAV606采用α/β热狗折叠，并在二聚体界面上具有活性位点。检查复杂的结构，我们注意到，包含Tyr-53-Asn-61的底

  DOI：

  10.1074/jbc.m117.792549
• 作为产物：
  描述：

  巴豆酸 、 N-乙酰基半胱胺 在 4-二甲氨基吡啶 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 生成 螺[1-氮杂二环[2.2.1]庚烷-3,5-噁唑烷]-2-酮(9CI)
  参考文献：
  名称：

  来自迭代高度还原性真菌聚酮合酶的分离烯酰还原酶催化结构域的底物选择性揭示了编程的关键组成部分†

  摘要：

  首次从真菌高还原性重复聚酮合酶(HR-iPKS)中分离出顺式烯酰还原酶(ER)催化结构域并进行体外研究。来自角鲨他汀四酮化合物合酶的 ER 在溶液中形成离散的二聚体蛋白质。ER 显示出广泛的底物选择性，可减少烯酰基物质，包括天然和非天然底物。泛硫氨酸结合底物硫醇酯的反应速度比相应的 SNAC 硫醇酯快得多。非天然底物包括Z-烯烃、2-乙基烯烃和五肽。底物的甲基化改变了 ER 的活性，使得 2,4-二甲基辛-2-烯酰基底物适合活性位点但不能被还原。开发了一种新的基于 NMR 的测定法，用于直接观察 NADPH 辅因子 4' 位置以及底物 C-2 和 C-3 位置的立体化学偏好。该测定表明，真菌 iPKS ER 催化的反应在立体化学上与脊椎动物 FAS (vFAS) 在辅因子 4' 位和底物 3 位的反应相同，但完整 SQTKS 所表现出的高立体选择性消失，导致在2 位对分离的 ER 没有选择性。ER

  DOI：

  10.1039/c6sc03496a

文献信息

• Substrate selectivity of an isolated enoyl reductase catalytic domain from an iterative highly reducing fungal polyketide synthase reveals key components of programming
  作者：Douglas M. Roberts、Christoph Bartel、Alan Scott、David Ivison、Thomas J. Simpson、Russell J. Cox

  DOI：10.1039/c6sc03496a

  日期：——

  A cis-acting enoyl reductase (ER) catalytic domain was isolated from a fungal highly reducing iterative polyketide synthase (HR-iPKS) for the first time and studied in vitro. The ER from the squalestatin tetraketide synthase forms a discrete dimeric protein in solution. The ER shows broad substrate selectivity, reducing enoyl species including both natural and unnatural substrates. Pantetheine-bound

  首次从真菌高还原性重复聚酮合酶(HR-iPKS)中分离出顺式烯酰还原酶(ER)催化结构域并进行体外研究。来自角鲨他汀四酮化合物合酶的 ER 在溶液中形成离散的二聚体蛋白质。ER 显示出广泛的底物选择性，可减少烯酰基物质，包括天然和非天然底物。泛硫氨酸结合底物硫醇酯的反应速度比相应的 SNAC 硫醇酯快得多。非天然底物包括Z-烯烃、2-乙基烯烃和五肽。底物的甲基化改变了 ER 的活性，使得 2,4-二甲基辛-2-烯酰基底物适合活性位点但不能被还原。开发了一种新的基于 NMR 的测定法，用于直接观察 NADPH 辅因子 4' 位置以及底物 C-2 和 C-3 位置的立体化学偏好。该测定表明，真菌 iPKS ER 催化的反应在立体化学上与脊椎动物 FAS (vFAS) 在辅因子 4' 位和底物 3 位的反应相同，但完整 SQTKS 所表现出的高立体选择性消失，导致在2 位对分离的 ER 没有选择性。ER
• Structural analysis of the dual-function thioesterase SAV606 unravels the mechanism of Michael addition of glycine to an α,β-unsaturated thioester
  作者：Taichi Chisuga、Akimasa Miyanaga、Fumitaka Kudo、Tadashi Eguchi

  DOI：10.1074/jbc.m117.792549

  日期：2017.6

  (R)-N-carboxymethyl-3-aminobutyric acid. We also determined the crystal structures of SAV606 both in ligand-free form at 2.4 Å resolution and in complex with (R)-N-carboxymethyl-3-aminobutyric acid at 2.0 Å resolution. We found that SAV606 adopts an α/β hotdog fold and has an active site at the dimeric interface. Examining the complexed structure, we noted that the substrate-binding loop comprising Tyr-53-Asn-61

  硫酯酶催化酰基硫酯的水解以释放羧酸或大环化以在脂肪酸，聚酮化合物或非核糖体肽的生物合成中产生相应的大环。最近，我们报道了来自链霉菌属的硫酯酶CmiS1。MJ635-86F5在大内酰胺抗生素克雷米霉素的生物合成中，催化甘氨酸向α，β-不饱和脂肪酰基硫代酯的迈克尔加成反应，然后经硫酯水解。但是，CmiS1催化反应的分子机制尚不清楚。在这里，我们报道了来自阿维链霉菌MA-4680的CmiS1同系物SAV606的功能和结构表征。体外分析表明，SAV606催化甘氨酸向巴豆酸硫酯的迈克尔加成反应，随后水解生成（R）-N-羧甲基-3-氨基丁酸。我们还确定了SAV606的晶体结构，既无配体形式，分辨率为2.4Å，又与（R）-N-羧甲基-3-氨基丁酸，复合物，分辨率为2.0Å。我们发现SAV606采用α/β热狗折叠，并在二聚体界面上具有活性位点。检查复杂的结构，我们注意到，包含Tyr-53-Asn-61的底