Structure-guided design of direct-acting antivirals that exploit the gem-dimethyl effect and potently inhibit 3CL proteases of severe acute respiratory syndrome Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) and middle east respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV)
作者:Chamandi S. Dampalla、Matthew J. Miller、Yunjeong Kim、Alexandria Zabiegala、Harry Nhat Nguyen、Trent K. Madden、Hayden A. Thurman、Alexandra J. Machen、Anne Cooper、Lijun Liu、Kevin P. Battaile、Scott Lovell、Kyeong-Ok Chang、William C. Groutas
DOI:10.1016/j.ejmech.2023.115376
日期:2023.6
prophylactics that can be used to counter the spread of SARS-CoV-2, and any emerging and re-emerging coronaviruses. We describe herein our efforts to address this urgent need by focusing on the structure-guided design of potent broad-spectrum inhibitors of SARS-CoV-2 3C-like protease (3CLpro or Main protease), an enzyme essential for viral replication. The inhibitors exploit the directional effects associated with
与 SARS-CoV-2 感染(COVID-19 的病原体)相关的高发病率和死亡率对全球公共卫生产生了重大影响。一系列疫苗和生物制剂的开发取得了重大进展,但是,SARS-CoV-2 变体的出现和突破性感染是一个持续的主要问题。此外,目前还缺乏可用于对抗 SARS-CoV-2 以及任何新出现和重新出现的冠状病毒传播的小分子宿主和针对病毒的治疗和预防药物。我们在此描述了我们为解决这一迫切需求所做的努力,重点关注 SARS-CoV-2 3C 样蛋白酶(3CL pro)的强效广谱抑制剂的结构导向设计或主要蛋白酶),一种病毒复制所必需的酶。抑制剂利用与偕二甲基的存在相关的定向效应,使抑制剂能够与酶的 S4 亚位点最佳相互作用。在生化和基于细胞的测定中发现了几种化合物可有效抑制 SARS-CoV-2 和 MERS-CoV 3CL 蛋白酶。具体而言,发现醛1c及其相应的亚硫酸氢盐加合物1d对 SARS-CoV-2的